[发明专利]用于识别扰动因子与皮肤病症相关基因之间的关联的系统和方法

权利要求书

1.一种用于识别潜在护肤剂的经改进的关联性映射方法，包括：

a)从皮肤组织样本构建病症标记；

b)为所述皮肤组织样本中存在的细胞类型构建基准标记；

c)通过所述基准标记过滤所述病症标记以提供偏向病症标记，其中所述偏向病症标记由多个上调基因和多个下调基因组成，这些基因全部具有等于或小于0.1的p值；

d)查询具有所述偏向病症标记的实例的数据库，其中每个实例与护肤剂相关联；

e)为每个实例生成关联性分数；以及

f)当所述数据库中的实例的所述关联性分数与所述偏向病症标记具有负相关性时，将与所述实例相关联的护肤剂识别为潜在护肤剂。

2.根据权利要求1所述的方法，其中构建所述病症标记包括：

a)从表现出感兴趣的皮肤病症的皮肤的一部分获得人皮肤组织样本；

b)从所述供体获得不表现出所述皮肤病症的人皮肤组织样本；

c)从(a)和(b)中的所述皮肤样本中的每个皮肤样本构建基因表达谱，其中所述基因表达谱各自包含表示所述基因表达谱中的基因的标识符列表；

d)将(c)中的所述基因表达谱互相比较，以识别差异表达的基因；

e)对代表所述差异表达基因的标识符列表进行等级排序；以及

f)从标识符的经等级排序的列表中选择多个上调基因和多个下调基因，以提供所述病症标记。

3.根据权利要求1或权利要求2所述的方法，其中构建所述基准标记包括：

a)将多个细胞暴露于基准皮肤试剂，其中所述多个细胞是期望所述基准标记的类型；

b)从所述多个细胞构建基因表达谱；

c)将来自与所述基准护肤剂接触的所述细胞的所述基因表达谱与对照谱进行比较，以识别差异表达的基因；以及

d)对代表所述差异表达基因的标识符列表进行等级排序，以提供所述基准标记。

4.根据任一项前述权利要求所述的方法，其中所述细胞类型选自由角质细胞、成纤维细胞、黑素细胞和黑素瘤细胞组成的组。

5.根据任一项前述权利要求所述的方法，其中所述感兴趣的皮肤病症是皮肤色素沉着过度病症。

6.根据任一项前述权利要求所述的方法，其中所述偏向病症标记中的所述多个上调基因和下调基因全部具有等于或小于0.05的p值。

7.根据任一项前述权利要求所述的方法，还包括确定所述数据库中的所述实例中的每个实例的关联性分数，并且如果所述实例具有负关联性分数，则与所述实例相关联的扰动因子被识别为在所述皮肤病症的所述治疗中具有潜在功效的推定皮肤试剂。

8.根据任一项前述权利要求所述的方法，其中所述基准护肤剂选自烟酰胺、间苯二酚、曲酸、熊果苷、脱氧熊果苷、维生素C化合物、维生素E化合物、巯基化合物、鞣花酸、葡糖胺、N-乙酰基葡糖胺、衣霉素、蛋白酶抑制剂、N-十一碳烯酰基苯丙氨酸、类视色素、己脒定、醋酸氟轻松、对苯二酚、维甲酸、氢化可的松、植物甾醇、甘草次酸、氨甲环酸、洋甘菊提取物、水杨酸、α-羟基酸、α-酮酸和一磷酸腺苷，醋酸氟轻松、对苯二酚和维甲酸的混合物，以及它们的组合。

9.根据任一项前述权利要求所述的方法，其中所述偏向病症标记包括50至200个上调基因和50至200个下调基因。

10.根据任一项前述权利要求所述的方法，其中构建所述病症标记和所述基准标记中的至少一者包括：从多个皮肤细胞提取信使RNA(mRNA)，以及将所述mRNA杂交至微阵列。

11.根据任一项前述权利要求所述的方法，其中构建所述病症标记和所述基准标记中的至少一者包括：从多个皮肤细胞提取mRNA，将所述mRNA逆转录成cDNA，以及将所述cDNA杂交至微阵列。