[发明专利]用于治疗炎症性肠病的组合物和方法

说明书

本文提供了可用于治疗和预防与炎症性肠病相关的并发症和副作用的细菌组合物。

对以电子方式提交的序列表的引用

与本申请一起提交的ASCII文本文件(名称：4268.014PC01_SequenceListing_ST25.txt；大小：8,737字节；以及创建日期：2019年3月29日)中的以电子方式提交的序列表的内容以引用的方式整体并入本文。

发明领域

本公开涉及在向受试者施用时可调节胆汁酸的水平的细菌组合物。所述细菌组合物可用于治疗和/或预防与炎症性肠病相关的并发症和副作用。

发明背景

炎症性肠病(IBD)是一种特征在于肠或结肠炎症的慢性胃肠道病症。IBD的症状可变化，但通常包括腹部痉挛、持续腹泻以及结肠直肠出血。IBD可具有致衰弱性，并且如果未经治疗，那么可具有危急生命的并发症。

溃疡性结肠炎和克罗恩氏病(Crohn's disease)是IBD的两种主要形式。尽管两者均是导致消化道炎症的病症，但它们关于胃肠(GI)道中炎症性反应的性质和位置有差异。溃疡性结肠炎限于结肠和肛门，并且由它引起的炎症仅影响粘膜。相比之下，克罗恩氏病可影响整个胃肠道，即从口至肛门，但它通常影响小肠的下部(回肠)。

对于IBD，不存在已知的治愈方法。当前治疗选项包括药物(例如消炎剂、免疫抑制剂和抗生素)、营养补充剂和手术。尽管所述治疗可减轻疾病的体征和症状，但它们通常具有有限功效和/或不利副作用。参见例如Martinez-Montiel M.P.等,Clin ExpGastroenterol 8:257-269(2015)；Cunliffe R.N.等,Aliment Pharmacol Ther 16(4):647-662(2002)。此外，尽管有可用的治疗选项，但IBD仍然是重大医学挑战，在世界范围内，IBD的发病率与患病率两者均在增加。M'Koma,A.E.,Clin Med Insights Gastroenterol6:33-47(2013)。因此，对于用于IBD的更安全和更有效的新治疗选项，存在强烈需要。

胆汁酸连同胆固醇、磷脂和胆红素一起构成胆汁的主要成分。它们在肝中从胆固醇合成，并且从肝细胞分泌至胆小管中并随后储存在胆囊中。在摄取食物之后，胆汁流入十二指肠中，在十二指肠中，它促进对脂溶性营养物的溶解和消化。Thomas等,Nat Rev DrugDiscov 7(8):678-693(2008)。因此，胆汁酸在传统上已被描述为对于胆固醇在胃肠道中的溶解以及对于刺激胆固醇、脂溶性维生素和脂质在肠中的吸收是重要的。Hylemon P.B.等,J Lipid Res 50(8):1509-1520(2009)。

更新近地，胆汁酸还已被描述为在许多其他生物过程中是重要的。举例来说，现时已知胆汁酸至少部分地通过G蛋白偶联受体(GPCR)(例如TGR5)与核激素受体(例如类法尼醇(farnesoid)X受体、孕烷X受体和维生素D受体)两者来起作用，并且不仅介导它们自身的生物合成，而且还介导其他脂质分子(例如胆固醇和甘油三酯)和葡萄糖的代谢。Thomas等,Nat Rev Drug Discov 7(8):678-693(2008)。胆汁酸还已被描述为在调节先天性免疫性与适应性免疫性两者方面起作用。Zhu C.等,Clin Exp Rheumatol 34:25-31(2016)。因此，可调节胆汁酸水平的生物制剂可为用于IBD的有用治疗选项。

发明内容

本公开涉及一种包含纯化细菌群体的组合物，其中所述纯化细菌群体包含黄杆菌_SC49(Flavonifractor_SC49)、柔嫩梭菌(Clostridium leptum)或它们的组合，并且其中所述组合物在向受试者施用时可调节次级胆汁酸的水平。在某些实施方案中，纯化细菌群体包含黄杆菌_SC49。在其他实施方案中，纯化细菌群体包含柔嫩梭菌。在其他实施方案中，纯化细菌群体包含黄杆菌_SC49与柔嫩梭菌两者。