[发明专利]化学平台辅助邻近捕获(CAP-C)在审
申请号: | 201980040272.5 | 申请日: | 2019-05-08 |
公开(公告)号: | CN112384524A | 公开(公告)日: | 2021-02-19 |
发明(设计)人: | 何川;游乾承 | 申请(专利权)人: | 芝加哥大学 |
主分类号: | C07H21/04 | 分类号: | C07H21/04;C12N15/00 |
代理公司: | 北京柏杉松知识产权代理事务所(普通合伙) 11413 | 代理人: | 王春伟;刘继富 |
地址: | 美国伊*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 化学 平台 辅助 邻近 捕获 cap | ||
1.一种方法,其包括:
(a)使靶标生物分子与包含可活化的交联部分的官能化支架接触以形成靶标/支架混合物;
(b)将靶标/支架混合物暴露于活化因子以活化官能化支架的交联部分并形成交联的靶标/支架复合物;
(c)分离靶标/支架复合物;和
(d)识别与支架交联的靶标生物分子的部分。
2.根据权利要求1所述的方法,其中支架是树状高分子或纳米颗粒。
3.根据权利要求2所述的方法,其中纳米颗粒是硅纳米颗粒、二氧化硅纳米颗粒、金纳米颗粒或量子点。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的方法,其中支架的直径为约1nm至100nm。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中使靶标生物分子至少与直径不同于第一支架的第二支架接触。
6.根据权利要求5所述的方法,其中首先将包含靶标生物分子的生物样品分成第一部分和第二部分,并且第一部分和第二部分各自分别与直径不同的第一支架和第二支架接触。
7.根据权利要求5或6所述的方法,其中第一支架和第二支架与不同的标记物或试剂连接。
8.根据权利要求5至7中任一项所述的方法,其中使靶标生物分子与至少三种不同的支架接触,其中每种支架与其他支架相比直径不同。
9.根据权利要求5至8中任一项所述的方法,其中首先将包含靶标生物分子的生物样品分成至少三个部分,并分别与不同的支架接触,其中每种支架与其他支架相比直径不同。
10.根据权利要求1至9中任一项所述的方法,其中靶标生物分子在包含一种或多于一种核酸、一种或多于一种多肽、或者一种或多于一种核酸和一种或多于一种多肽的分子复合物中。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的方法,其中活化因子是光。
12.根据权利要求11所述的方法,其中光是紫外光。
13.根据权利要求11所述的方法,其中光的波长为约350nm至375nm。
14.根据权利要求11所述的方法,其中光的波长为365nm。
15.根据权利要求1至10中任一项所述的方法,其中活化因子是温度变化。
16.根据权利要求1至10中任一项所述的方法,其中活化因子是pH变化。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的方法,其中官能化支架还包含至少第二官能团或第三官能团。
18.根据权利要求17所述的方法,其中至少第二官能团是标记、标签或第二交联部分。
19.根据权利要求18所述的方法,其中标记是成像剂。
20.根据权利要求18所述的方法,其中第二交联部分是蛋白质交联部分、或RNA交联部分、或DNA交联部分或其组合。
21.根据权利要求1至20中任一项所述的方法,其中官能化支架与一种或多于一种CRISPR序列或抗体连接。
22.根据权利要求1至21中任一项所述的方法,其中分离靶标/支架复合物还包括将靶标/支架复合物暴露于蛋白酶、核酸酶、生物素-蛋白连接酶或其他酶或条件,形成经处理的靶标/支架复合物。
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