[发明专利]通过定量组织形态学分析确定组织效力

说明书

公开了用于进行定量组织病理学分析以确定组织效力的系统和方法。根据一些实施例，提供了一种训练组织分类器的方法。根据所述方法，训练所述组织分类器包含生成对照库中的载玻片图像内检测到的核的特征指纹，并基于其对应的特征指纹聚类所述载玻片图像。根据一些实施例，提供了一种用于利用经训练的组织分类器的方法。根据所述方法，所述经训练的组织分类器确定未知载玻片图像中的组织是否对应于在所述组织分类器的训练期间聚类的载玻片图像。

相关申请的交叉引用

本申请要求于2018年7月6日提交的美国临时申请第62/694,829号的权益和优先权，所述美国临时申请的主题通过引用并入本文。

技术领域

所描述的实施例涉及用于对组织样品内的细胞的数字图像进行定量组织形态学分析以确定可行的移植组织候选者的定量方法。

背景技术

通过参考同种异体经培养的出生后胸腺组织来源的产品的制备可以理解本发明，但本发明的公开内容和权利要求书并不限于本发明的这种实施例。

已显示同种异体经培养的出生后胸腺组织来源的产品可用于治疗由先天性无胸腺症引起的T细胞免疫缺陷(原发性免疫缺陷)，例如用于治疗与22q11.2缺失相关联的完全迪乔治异常(complete DiGeorge Anomaly，cDGA)和与chd7(染色体域-解旋酶-DNA结合蛋白7)基因突变相关联的CHARGE(眼组织缺损、心脏缺陷、胆道闭锁、生长或智力低下、生殖器发育不全和耳朵异常或耳聋)综合征以及用于治疗缺乏叉头盒蛋白N1(FOXN1)的无胸腺症患者。先天性无胸腺症是一种罕见的致命疾病，目前尚无利用经监管批准的药品进行的药物治疗选择。

保留胸腺上皮细胞(TEC)的同种异体经培养的出生后胸腺组织来源的产品的实验性移植已成功用于治疗患先天性无胸腺症的儿科患者(Markert ML、Devlin BH、McCarthyEA,2010,“胸腺移植(Thymus transplantation)”《临床免疫学(Clin Immunol.)》,135(2):236-46；Markert ML等人,2004,“具有免疫抑制的出生后胸腺移植用于治疗迪乔治综合征(Postnatal thymus transplantation with immunosuppression as treatment forDiGeorge syndrome)”《血液学(Blood)》104(8):2574-2581；Markert ML等人,1999,“完全迪乔治综合征中的胸腺组织移植(Transplantation of thymus tissue in completeDiGeorge syndrome)”《新英格兰医学杂志(N Engl J Med)》341(16):1180-1189 27)。

同种异体经培养的出生后胸腺组织来源的产品是组织工程化产品，其被制备、培养和储存长达21天以产生部分T细胞耗竭的胸腺组织切片，并且通过预处理过程与天然胸腺相区别。预处理方案从经培养的胸腺组织切片中部分耗尽供体胸腺细胞。根据体外数据(免疫组织化学)，如使用细胞角蛋白抗体所评估的，介于12天与21天之间的培养时间段可以保留上皮网络。优选在37℃下在5％CO₂的培养箱中进行培养。

培养过程以以下方式显著改变了供体胸腺组织和其中包含的组成细胞的生物学特性，以优化同种异体经培养的出生后胸腺组织来源的产品切片的有效治疗特性。培养过程确保以适合于通过外科手术植入受试者体内的方式获得具有先决生物学特征的培养细胞/组织的确定组成，以使其能够重建受试者的免疫系统。培养过程导致胸腺细胞的损失以及供体胸腺组织切片中胸腺上皮细胞和其它基质细胞的相对富集。培养过程进一步导致胸腺细胞耗竭并维持TEC，以使受体的免疫系统重建，并使受体对供体胸腺中的HLA抗原产生耐受性。总的来说，制造过程被设计成从供体胸腺组织中耗尽胸腺细胞并保留胸腺基质(胸腺上皮细胞和成纤维细胞)的功能结构。