[发明专利]光谱校正装置及光谱校正方法

说明书

本发明提供一种光谱校正装置及光谱校正方法，即使在荧光色素间同时出现峰的情况下也能够高精度地进行光谱校正。光谱校正装置算出用于颜色变换处理的颜色变换矩阵，包括：分光信号取得部，其取得随时间而检测到的荧光的分光信号；候选算出部，其基于所述分光信号，针对依赖于荧光色素的荧光的峰同时出现的频度的参数的每个值，算出颜色变换矩阵的候选；以及选择部，其基于针对各候选算出的评价值来选择颜色变换矩阵。

技术领域

本发明涉及毛细管电泳型测序仪(Sequencer)的光谱校正装置及光谱校正方法。

背景技术

毛细管电泳型测序仪是一边使核酸试样在被称为毛细管的细管中电泳，一边对利用激发光的照射而产生的荧光进行分光并随时间来检测，使用检测到的信号来分析核酸的装置。具体而言，进行确定构成核酸的碱基序列的测序处理和比较DNA片段的链长的片段解析处理。在测序处理和片段解析处理的过程中实施颜色变换处理。颜色变换处理是将分光后的信号的时间序列数据变换为标识核酸试样的荧光色素的荧光的时间序列数据的处理，将与各荧光色素的光谱响应特性对应的颜色变换矩阵的伪逆矩阵乘以检测到的信号的时间序列数据来进行。

取得颜色变换矩阵的处理被称为光谱校正，在专利文献1中公开了使用由能够识别光谱的多个分子化学种类生成的电泳图的光谱校正方法。即，通过对由电泳图生成的数据矩阵的部分进行秩分析来识别具有光谱响应特性的区域，将根据识别出的区域判定的纯成分光谱响应分成簇，将各簇的代表性的光谱响应与分子化学种类相关联。

现有技术文献

专利文献

专利文献1：国际公开WO01/055699号公报

发明内容

发明要解决的课题

然而，在专利文献1中，假定在电泳图的时间区域中，表示荧光色素的各峰充分地分离，在荧光色素间同时出现峰的情况下，光谱校正的精度降低。在毛细管电泳型测序仪中，随着装置的小型化，毛细管变短，因此在毛细管内难以分离碱基，被检测的信号的峰的重叠增加。

因此，本发明的目的在于提供一种即使在荧光色素间同时出现峰的情况下，也能够高精度地进行光谱校正的光谱校正装置以及光谱校正方法。

用于解决课题的手段

为了实现上述目的，本发明是一种光谱校正装置，其算出用于颜色变换处理的颜色变换矩阵，其中，包括：分光信号取得部，其取得随时间而检测到的荧光的分光信号；候选算出部，其基于所述分光信号，针对依赖于荧光色素的荧光的峰同时出现的频度的参数的每个值，算出颜色变换矩阵的候选；以及选择部，其基于针对各候选算出的评价值来选择颜色变换矩阵。

另外，本发明是一种光谱校正方法，其算出用于颜色变换处理的颜色变换矩阵，包括：取得步骤，取得随时间而检测到的荧光的分光信号；候选算出步骤，基于所述分光信号，针对依赖于荧光色素的荧光的峰同时出现的频度的参数的每个值，算出颜色变换矩阵的候选；以及选择步骤，基于针对各候选算出的评价值来选择颜色变换矩阵。

发明效果

根据本发明，能够提供即使在荧光色素间同时出现峰的情况下，也能够高精度地进行光谱校正的光谱校正装置以及光谱校正方法。

附图说明

图1是光谱校正装置的硬件结构图。

图2是说明检测到的分光信号的例子、分光信号与颜色变换矩阵、荧光的时间强度的关系的图。

图3是实施例1的功能框图。

图4是表示实施例1的处理的流程的一例的图。

图5是表示实施例1的初始值的计算处理的流程的一例的图。

图6是表示实施例1的颜色变换矩阵的候选的计算处理的流程的一例的图。