[发明专利]用有限体积阵列进行样品细胞表型评估的组合物和方法在审
申请号: | 201980053262.5 | 申请日: | 2019-06-13 |
公开(公告)号: | CN112840203A | 公开(公告)日: | 2021-05-25 |
发明(设计)人: | 马修·费舍尔;尼古拉斯·阿拉伯;罗丝·约翰逊;大卫·布西安 | 申请(专利权)人: | 派特恩生物技术有限公司 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64;G01N33/50;G06N3/02;G06N3/08;G16C20/70;G16H10/40 |
代理公司: | 北京柏杉松知识产权代理事务所(普通合伙) 11413 | 代理人: | 邱俊霞;王春伟 |
地址: | 美国德*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 有限 体积 阵列 进行 样品 细胞 表型 评估 组合 方法 | ||
1.一种用于评估样品的方法,其包括:
(a)将样品分成两个或多于两个子样品或样品部分,包含对照子样品和至少一个测试样品;
(b)将每个子样品或样品部分与一种或多于一种试剂、一种或多于一种反应物、或一种或多于一种试剂和一种或多于一种反应物混合,形成不同的子样品或样品部分混合物;
(c)将每个子样品或样品部分混合物分区至多个小体积区室,其中一些小体积区室含有一个细胞或一个细胞聚集体;
(d)检测小体积区室的物理或化学特征随时间的变化并生成与每个区室相关的数据;和
(e)将数据作为输入信息传输到使用机器学习优化的至少一个函数并生成分析输出信息。
2.根据权利要求1所述的方法,其还包括:
(f)将数据作为输入信息传输到(i)至少一个神经网络和(ii)表征器,形成神经网络输出信息和表征器输出信息;
(g)将神经网络输出信息传输到分类器并形成分类器输出信息;和
(h)将表征器输出信息和分类器输出信息传输到第二神经网络,所述第二神经网络形成分析输出信息。
3.根据权利要求1所述的方法,其中所述样品是环境样品或生物样品。
4.根据权利要求3所述的方法,其中所述生物样品是患者样品。
5.根据权利要求4所述的方法,其中所述患者是人类患者。
6.根据权利要求4所述的方法,其中所述生物样品是支气管肺泡灌洗液(BAL)、痰、唾液、尿液、血液、脑脊液、精液、粪便、拭子、刮除物、脓或组织。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述对照子样品不包含反应物。
8.根据权利要求1所述的方法,其中所述对照子样品不包含试剂。
9.根据权利要求1所述的方法,其中将一个或多于一个子样品与试剂和反应物混合。
10.根据权利要求1所述的方法,其中所述反应物是营养混合物或药物。
11.根据权利要求1所述的方法,其中所述试剂为荧光试剂或发光试剂。
12.根据权利要求1所述的方法,其中所述分析输出信息是临床终点的决定。
13.根据权利要求12所述的方法,其中所述临床终点是患者治疗成效、药物的最小抑制浓度、易感或耐药细胞、或预后。
14.根据权利要求13所述的方法,其中所述预后是住院持续时间或对象的不良事件风险。
15.一种用于评估样品的方法,其包括:
(a)将样品分成两个或多于两个子样品或样品部分,包含对照子样品和至少一个测试样品;
(b)将每个子样品或样品部分与一种或多于一种试剂、一种或多于一种反应物、或一种或多于一种试剂和一种或多于一种反应物混合,形成不同的子样品或样品部分混合物;
(c)将每个子样品或样品部分混合物分区至多个小体积区室,其中一些小体积区室含有一个细胞或一个细胞聚集体;
(d)检测小体积区室的物理或化学特征随时间的变化以及与每个区室相关的数据;
(e)将收集的数据作为输入信息传输到(i)至少一个神经网络和(ii)表征器,形成神经网络输出信息和表征器输出信息;
(f)将神经网络输出信息传输到分类器并形成分类器输出信息;和
(g)将表征器输出信息、分类器输出信息、社区信息和患者信息传输到第二神经网络,所述第二神经网络形成分析输出信息。
16.根据权利要求15所述的方法,其还包括对照子样品。
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