[发明专利]寡核苷酸的检测方法或定量方法在审
申请号: | 201980055748.2 | 申请日: | 2019-09-10 |
公开(公告)号: | CN112639093A | 公开(公告)日: | 2021-04-09 |
发明(设计)人: | 大森茜;涩泽幸一 | 申请(专利权)人: | 积水医疗株式会社 |
主分类号: | C12N15/09 | 分类号: | C12N15/09;C12Q1/682;C12Q1/6876 |
代理公司: | 中科专利商标代理有限责任公司 11021 | 代理人: | 宋明 |
地址: | 日本国*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 寡核苷酸 检测 方法 定量 | ||
1.样品中靶标寡核苷酸的检测方法,包括以下步骤:
(i)使用于捕获靶标寡核苷酸的捕获探针与样品接触,
所述捕获探针包含:
(A)核酸探针,和
(B)与所述核酸探针的3'端或5'端的核苷酸邻接的固相或衔接子或接头,
所述核酸探针包含与靶标寡核苷酸的全部或部分序列互补的序列;
(ii)使单链特异性核酸酶与经历了与所述捕获探针的接触步骤的样品接触;
(iii)在进行了与所述单链特异性核酸酶的接触步骤之后,将所述样品中的捕获探针形成单链;
(iv)使由第一寡核苷酸和第二寡核苷酸构成的能够自聚集的一对探针与经历了将捕获探针形成单链的步骤的样品接触,以形成捕获探针和寡核苷酸聚合物的复合物,所述寡核苷酸聚合物由所述第一寡核苷酸和第二寡核苷酸的自聚集产生;和
(v)检测所述复合物。
2.根据权利要求1所述的靶标寡核苷酸的检测方法,其中由所述第一寡核苷酸和第二寡核苷酸构成的能够自聚集的探针对中的至少一种寡核苷酸包含靶标寡核苷酸的全部或部分序列。
3.根据权利要求1所述的靶标寡核苷酸的检测方法,其中(iv)的复合物形成步骤包括
与辅助探针接触的步骤,所述辅助探针含有靶标寡核苷酸的全部或部分序列,以及与所述第一寡核苷酸和第二寡核苷酸中的至少一种的全部或部分序列互补的序列。
4.样品中靶标寡核苷酸的检测方法,包括以下步骤:
(i)向样品中的靶标寡核苷酸添加第一多核苷酸;
(ii)使用于捕获所述靶标寡核苷酸的捕获探针与所述靶标寡核苷酸接触,
所述捕获探针包含
(A)核酸探针,
(B)与所述核酸探针的3'端或5'端的核苷酸邻接的固相或衔接子或接头,
所述核酸探针包含与所述靶标寡核苷酸的全部或部分序列和/或所述第一多核苷酸的全部或部分序列互补的序列;
(iii)使单链特异性核酸酶与经历了添加第一多核苷酸的步骤以及与捕获探针的接触步骤的样品接触;
(iv)在进行了与单链特异性核酸酶的接触步骤之后,将所述样品中的捕获探针形成单链;
(v)使由第一寡核苷酸和第二寡核苷酸构成的能够自聚集的一对探针与经历了将捕获探针形成单链的步骤的所述样品接触,以形成捕获探针和寡核苷酸聚合物的复合物,所述寡核苷酸聚合物由所述第一寡核苷酸和第二寡核苷酸的自聚集产生;和
(vi)检测所述复合物。
5.根据权利要求4所述的靶标寡核苷酸的检测方法,其中
向所述样品中的所述靶标寡核苷酸添加所述第一多核苷酸的步骤(i)为在与捕获探针的接触步骤之前将所述第一多核苷酸添加到所述样品中的所述靶标寡核苷酸的步骤。
6.根据权利要求4所述的靶标寡核苷酸的检测方法,其中
向所述样品中的所述靶标寡核苷酸添加所述第一多核苷酸的步骤(i)为在与捕获探针的接触步骤之后将所述第一多核苷酸添加到所述样品中的所述靶标寡核苷酸的步骤。
7.根据权利要求4至6中任一项所述的靶标寡核苷酸的检测方法,其中
由所述第一寡核苷酸和第二寡核苷酸构成的能够自聚集的探针对中的至少一种寡核苷酸包含所述第一多核苷酸的全部或部分序列。
8.根据权利要求4至6中任一项所述的靶标寡核苷酸的检测方法,其中
形成复合物的步骤(v)包括与辅助探针接触的步骤,其中
所述辅助探针包含所述靶标寡核苷酸的全部或部分序列和/或所述第一多核苷酸的全部或部分序列,以及与第一寡核苷酸和第二寡核苷酸之一的全部或部分序列互补的序列。
9.根据权利要求4至8中任一项所述的靶标寡核苷酸的检测方法,其中所述第一多核苷酸具有聚(A)序列、聚(T)序列、聚(U)序列、聚(T/U)序列、聚(G)序列或聚(C)序列。
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