[发明专利]具有改良链置换能力的突变型DNA聚合酶在审
申请号: | 201980059768.7 | 申请日: | 2019-09-12 |
公开(公告)号: | CN112703248A | 公开(公告)日: | 2021-04-23 |
发明(设计)人: | F·库尔巴诺夫 | 申请(专利权)人: | 豪夫迈·罗氏有限公司 |
主分类号: | C12N9/12 | 分类号: | C12N9/12;C12Q1/6869;C12N15/09 |
代理公司: | 中国专利代理(香港)有限公司 72001 | 代理人: | 甘霖;李唐 |
地址: | 瑞士*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 具有 改良 置换 能力 突变型 dna 聚合 | ||
1.一种DNA聚合酶,其与对照DNA聚合酶相比具有增加的5′-3′链置换活性和显著降低的5′-3′核酸外切酶和核酸内切酶活性,其中所述DNA聚合酶的氨基酸序列在与SEQ ID NO:1的以下位置相对应的位置包含一个或多个突变、或突变的组合:
686、693、516、633、415、420、636、752、768、525、694、491、516、515、666、402、555、582、737、759、521、546、668、456、507、571、652、832、498、524、598、616、444、498、660、673、493、511、648、749和635,并且其中,所述对照DNA聚合酶包含SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:40或SEQID NO:42的氨基酸序列。
2.根据权利要求1所述的DNA聚合酶,其中在SEQ ID NO:1的对应位置的所述一个或多个突变、或突变的组合选自:
I686V、A693V、T516I、V633I、Q415H、E420D、E636G、N752S、V768M、R525G、F694S、Q491H、T516S、S515F、T666M、E402V、V555A、N582D A737T、A759T、L521Q、T546A、N668S、A456T、K507M、T571A、S652F、S515F、A832V、D498E、L524V、R598G、M616I、A444T、D498E、M660K、Y673N、E493D、T511S、M648I、M749L和/或Q635K。
3.根据权利要求1所述的DNA聚合酶,其中:
i.与SEQ ID NO:1的位置686相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除I以外的任何氨基酸;
ii.与SEQ ID NO:1的位置693相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除A以外的任何氨基酸;
iii.与SEQ ID NO:1的位置516相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除T以外的任何氨基酸;
iv.与SEQ ID NO:1的位置633相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除V以外的任何氨基酸;
v.与SEQ ID NO:1的位置415相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除Q以外的任何氨基酸;
vi.与SEQ ID NO:1的位置420相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除E以外的任何氨基酸;
vii.与SEQ ID NO:1的位置636相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除E以外的任何氨基酸;
viii.与SEQ ID NO:1的位置752相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除N以外的任何氨基酸;
ix.与SEQ ID NO:1的位置768相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除V以外的任何氨基酸;
x.与SEQ ID NO:1的位置525相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除R以外的任何氨基酸;
xi.与SEQ ID NO:1的位置694相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除F以外的任何氨基酸;
xii.与SEQ ID NO:1的位置491相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除Q以外的任何氨基酸;
xiii.与SEQ ID NO:1的位置515相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除S以外的任何氨基酸;
xiv.与SEQ ID NO:1的位置666相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除T以外的任何氨基酸;
xv.与SEQ ID NO:1的位置402相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除E以外的任何氨基酸;
xvi.与SEQ ID NO:1的位置555相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除V以外的任何氨基酸;
xvii.与SEQ ID NO:1的位置582相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除N以外的任何氨基酸;
xviii.与SEQ ID NO:1的位置737相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除A以外的任何氨基酸;
xix.与SEQ ID NO:1的位置759相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除A以外的任何氨基酸;
xx.与SEQ ID NO:1的位置521相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除L以外的任何氨基酸;
xxi.与SEQ ID NO:1的位置546相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除T以外的任何氨基酸;
xxii.与SEQ ID NO:1的位置668相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除N以外的任何氨基酸;
xxiii.与SEQ ID NO:1的位置456相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除A以外的任何氨基酸;
xxiv.与SEQ ID NO:1的位置507相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除K以外的任何氨基酸;
xxv.与SEQ ID NO:1的位置571相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除T以外的任何氨基酸;
xxvi.与SEQ ID NO:1的位置652相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除S以外的任何氨基酸;
xxvii.与SEQ ID NO:1的位置832相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除A以外的任何氨基酸;
xxviii.与SEQ ID NO:1的位置498相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除D以外的任何氨基酸;
xxix.与SEQ ID NO:1的位置524相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除L以外的任何氨基酸;
xxx.与SEQ ID NO:1的位置598相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除R以外的任何氨基酸;
xxxi.与SEQ ID NO:1的位置616相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除M以外的任何氨基酸;
xxxii.与SEQ ID NO:1的位置444相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除A以外的任何氨基酸;
xxxiii.与SEQ ID NO:1的位置660相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除M以外的任何氨基酸;
xxxiv.与SEQ ID NO:1的位置673相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除Y以外的任何氨基酸;
xxxv.与SEQ ID NO:1的位置493相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除E以外的任何氨基酸;
xxxvi.与SEQ ID NO:1的位置511相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除T以外的任何氨基酸;
xxxvii.与SEQ ID NO:1的位置648相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除M以外的任何氨基酸;
xxxviii.与SEQ ID NO:1的位置749相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除M以外的任何氨基酸;和/或
xxxix.与SEQ ID NO:1的位置635相对应的所述DNA聚合酶的氨基酸是除Q以外的任何氨基酸。
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