[发明专利]基于血液的肿瘤突变负荷预测非小细胞肺癌的总存活

说明书

本披露内容总体上涉及用于治疗非小细胞肺癌患者的方法，所述方法基于使用基于血液的肿瘤突变负荷来预测用德瓦鲁单抗、曲美木单抗和/或化疗剂治疗的患者的总存活。本披露内容还涉及基于与对免疫疗法的敏感性或抗性相关的循环肿瘤DNA中的突变进行鉴定来治疗非小细胞肺癌患者的方法。

技术领域

本披露内容总体上涉及用于治疗非小细胞肺癌患者的方法，所述方法基于使用基于血液的肿瘤突变负荷来预测用德瓦鲁单抗(Durvalumab)和/或曲美木单抗(tremelimumab)和/或化疗剂治疗的患者的总存活。本披露内容还涉及基于与对免疫疗法的敏感性或抗性相关的循环肿瘤DNA中的突变进行鉴定来治疗非小细胞肺癌患者的方法。

背景技术

具有高治疗前肿瘤突变负荷(“TMB”)的非小细胞肺癌(“NSCLC”)患者在用免疫检查点抑制剂治疗后已显示出改善的结果(Yarchoan等人，N.Engl.J.Med.[新英格兰医学杂志]377(25)：2500-01(2017)；Snyder等人，N.Engl.J.Med.[新英格兰医学杂志]371(23)：2189-99(2014)；Le等人，Science[科学]357(6349)：409-13(2017)；Rizvi等人，Science[科学]348(6230)：124-28(2015)；Rizvi等人，J.Clin.Oncol.[临床肿瘤学杂志]36(7)：633-41(2018)；Hellmann等人，Cancer Cell[癌细胞]33(5)：843-52(2018)；Carbone等人，N.Engl.J.Med.[新英格兰医学杂志]376(25)：2415-26(2017)；Hellmann等人，N.Engl.J.Med.[新英格兰医学杂志]378(22)：2093-104(2018))。在血液中测量TMB也已经成为丰富对PD-1/L1疗法有应答的NSCLC患者的有前途的新方法(Gandara等人，Ann.Oncol.[肿瘤学年鉴]28(增刊5)：v460-v496(2017)；Planchard等人，Ann.Oncol.[肿瘤学年鉴]29(增刊4)：iv192-iv237(2018))。报告显示，在一线和二线环境中具有高血液TMB(“bTMB”)的NSCLC患者具有改善的无进展存活和应答率。然而，组织TMB(“tTMB”)或bTMB与用抗PD-1/L1抗体治疗的NSCLC患者的总存活之间的相关性尚未显示。

发明内容

本披露内容提供一种在有需要的患者中预测癌症治疗成功的方法，其包括确定患者的肿瘤突变负荷(TMB)，其中高TMB预测治疗成功。

本披露内容还提供一种在有需要的患者中治疗癌症的方法，其包括：(a)确定患者的TMB；(b)确定TMB是高还是低；以及(c)如果TMB高则治疗或继续治疗，或者如果TMB低则不治疗或中止治疗。

本披露内容还提供一种在有需要的患者中预测癌症治疗成功的方法，其包括确定所述患者是否在含富含AT的相互作用结构域的蛋白1A基因(ARID1A)中具有体细胞突变，其中体细胞突变预测治疗成功。

本披露内容还提供一种在有需要的患者中治疗癌症的方法，其包括：(a)确定所述患者是否在丝氨酸/苏氨酸激酶11基因(STK11)、Kelch样ECH相关蛋白1基因(KEAP1)、含富含AT的相互作用结构域的蛋白1A基因(ARID1A)或K-Ras基因中的至少一个中具有体细胞突变；以及(b)如果患者在丝氨酸/苏氨酸激酶11基因(STK11)、Kelch样ECH相关蛋白1基因(KEAP1)、含富含AT的相互作用结构域的蛋白1A基因(ARID1A)或K-Ras基因中的至少一个中具有体细胞突变，则治疗或继续治疗。

本披露内容的其他特征和优点将根据具体实施方式和权利要求书变得明显。

附图说明

图1显示包括在TMB分析中的基因列表。

图2显示用德瓦鲁单抗(D)相对于化疗(CT)或德瓦鲁单抗和曲美木单抗(D+T)相对于化疗(CT)治疗的肿瘤细胞(TC)具有PD-L1表达≥25％的患者的总存活。