[发明专利]用于对骨髓干细胞疗法的响应的预测的方法

权利要求书

1.一种用于对疾病治疗、尤其心血管再生的响应的预测的方法，其中所述方法包括

(i)在受试者的样本中确定一基因和/或基因表达作为生物标志物，其中所述基因和/或基因表达包括突变变异体，

(ii)将被确定的基因和/或基因表达突变变异体与基线值和/或基准比较，优选与没有体细胞突变的基因和/或基因表达的非疾病类型或个体的参考细胞的基线值和/或基准比较，

(iii)基于所述比较的结果在所述受试者中预测对疾病治疗、尤其组织修复、优选心脏修复的响应是被预期的、不被预期的还是含糊不定的。

2.根据权利要求1所述的用于对疾病治疗、尤其心血管再生的响应的预测的方法，其中所述方法包括

(i)在受试者的样本中确定SH2B3-基因和/或SH2B3-基因表达作为生物标志物，其中所述SH2B3-基因和/或SH2B3-基因表达包括突变变异体，

(ii)将该被确定的SH2B3-基因和/或SH2B3-基因表达突变变异体与基线值和/或基准比较，优选与没有体细胞突变的基因和/或基因表达的SH2B3非疾病类型或个体的参考细胞的基线值和/或基准比较，

(iii)基于所述比较的结果在所述受试者中预测对疾病治疗、尤其组织修复、优选心脏修复的响应是被预期的、不被预期的还是含糊不定的。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述SH2B3-基因和/或SH2B3-基因表达是敲除基因和/或敲除基因表达变异体。

4.根据权利要求2和/或3所述的方法，其中所述SH2B3-基因和/或SH2B3-基因表达包含SH2B3-基因和/或SH2B3-基因表达变异体1和/或SH2B3-基因和/或SH2B3-基因表达变异体2中的至少一个突变。

5.根据权利要求2、3和/或4所述的方法，其中所述SH2B3-基因和/或SH2B3-基因表达包含根据SEQ ID NO:1和/或SEQ ID NO:2的序列。

6.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述方法还使用LNK蛋白表达和/或SH2B3-基因和/或SH2B3-基因表达变异体的功能的分析。

7.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述方法还使用一个或更多个生物标志物，其中其它生物标志物选自血管生成因子、存活因子、趋化因子、循环内皮祖细胞(EPC)、循环内皮细胞(CEC)、循环血小板、循环单核细胞和亚群、MNC亚群和/或全基因组序列RNA上的受体/配体表达。

8.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述生物标志物优选选自PLCG1、EPO、LPCAT2、GRB2、AP1B1、AFAP1、KLF8、MARK3、REX1BD、SACM1L、PDGFRB、VEGF、BEX3、Delta_CT_SH2B3、ZNF205、LTB、EMG1、CD34+细胞/ml PB、BAZ1A和/或CD133+细胞/ml PB，更优选选自PLCG1、EPO、LPCAT2、GRB2、AP1B1、AFAP1、KLF8、MARK3、REX1BD、SACM1L、PDGFRB和/或VEGF。

9.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中预测准确性的灵敏度和特异性高于约90％，优选地高于约92％，更优选地高于约93％，最优选地高于约94％。

10.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中PLCG1、LPCAT2、GRB2、AP1B1、AFAP1、KLF8、MARK3、REX1BD、SACM1L、PDGFRB、BEX3、ZNF205、EMG1、BAZ1A和/或LTB在RNA水平上被测定和/或其中EPO和/或VEGF在蛋白质水平上被测定。

11.根据前述权利要求中任一项所述的方法，其中所述方法用于对干细胞疗法和/或血管生成响应的诱导和/或包括心肌梗塞、中风和外周缺血性血管疾病、心脏病在内的心血管疾病的组织修复和/或缺血预处理的响应的术前预测。