[发明专利]一种用于预测丹参花色的SNP分子标记及其应用

权利要求书

1.一种预测丹参花色的方法，其特征在于，具体步骤如下：

(1)提取待测丹参花瓣的转录组RNA；

(2)以提取的RNA为模板，利用引物组，进行qPCR扩增，得到cDNA；

所述引物组的引物序列如下：

正向引物F3′5′HF：5′-ATGCAAGGTGAAGAATGT-3′；

反向引物F3′5′HR：5′-CTAGCTAGCTGCATAACAATG-3′；

(3)以qPCR扩增得到的cDNA为模板，利用所述引物组，进行PCR扩增，得到DNA；

(4)分析PCR扩增产物，从而对SNP分子标记位点，与提供的标准序列进行比对，进而判定花色；

所述SNP分子标记基于丹参基因F3′5′H，所述分子标记位于该基因的1230位点，此处碱基为T，则鉴定为紫花或浅紫花，此处碱基为C，则鉴定为白花或浅紫花。

2.根据权利要求1所述的一种预测丹参花色的方法，其特征在于，步骤(3)所述PCR扩增反应总体系为25μL，其中cDNA 1μL、PCRBuffer2.5μL、dNTP2μL、正向引物和反向引物各1μL、pyrobest DNATaq酶0.25μL和ddH₂O17.25μL。

3.根据权利要求1所述的一种预测丹参花色的方法，其特征在于，步骤(3)所述PCR扩增程序设置为95℃5min；30cycles：94℃30s，56℃30s，72℃2min；72℃10min。

4.权利要求1-3任一项所述的一种预测丹参花色的方法在丹参花色鉴别中应用。