[发明专利]一种引物探针组合物及检测方法和用途在审
申请号: | 202010031581.0 | 申请日: | 2020-01-13 |
公开(公告)号: | CN111118140A | 公开(公告)日: | 2020-05-08 |
发明(设计)人: | 蔡燕宁;张陆明 | 申请(专利权)人: | 首都医科大学宣武医院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 北京精金石知识产权代理有限公司 11470 | 代理人: | 宋秀兰 |
地址: | 100053*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 引物 探针 组合 检测 方法 用途 | ||
1.一种引物探针组合物,其特征在于,所述引物的核苷酸序列包括:SEQ ID NO.1-2和SEQ ID NO.7-8中的至少两种,所述探针的核苷酸序列包括:SEQ ID NO.3-6和SEQ IDNO.9-12中的至少两种。
2.根据权利要求1所述的引物探针组合物,其特征在于,所述引物探针组合物包括:SEQID NO.1-4组合,SEQ ID NO.1-2和SEQ ID NO.5-6组合,SEQ ID NO.7-10组合,SEQ IDNO.7-8和SEQ ID NO.11-12组合中的至少一个组合。
3.根据权利要求1或2所述的引物探针组合物,其特征在于,所述探针的5’端标记有荧光报告基团,所述探针的3’端标记有淬灭基团;优选地,所述荧光报告基团为FAM、HEX、VIC、JOE和ROX中的至少一种,所述淬灭基团为NFQ-MGB基团。
4.根据权利要求3所述的引物探针组合物,其特征在于,所述引物探针组合物包括:
1)用于CpG岛位置1甲基化水平检测的引物探针组合:
SEQ ID NO.1:5’-ATGAAATGGAAGTGTAAGGAGG-3’,
SEQ ID NO.2:5’-ACCCTCAACTATCTACCCTAAAC-3’,
SEQ ID NO.3:5’-CTTATTAACCCGTTACC-3’,
SEQ ID NO.4:5’-TATTAACCCATTACCAC-3’;
2)用于CpG岛位置2甲基化水平检测的引物探针组合:
引物:SEQ ID NO.1:5’-ATGAAATGGAAGTGTAAGGAGG-3’,
SEQ ID NO.2:5’-ACCCTCAACTATCTACCCTAAAC-3’,
SEQ ID NO.5:5’-TCACACTCGCGAAC-3’,
SEQ ID NO.6:5’-CTCACACTCACAAACC-3’;
3)用于CpG岛位置3甲基化水平检测的引物探针组合:
SEQ ID NO.7:5’-GTGTAAGGAGGTTAAGTTAATAGGT-3’,
SEQ ID NO.8:5’-CCCACCCTCAACTATCTACC-3’,
SEQ ID NO.9:5’-CCCGCGCCAACAC-3’,
SEQ ID NO.10:5’-CCCACACCAACACT-3’;
4)用于CpG岛位置4甲基化水平检测的引物探针组合:
SEQ ID NO.7:5’-GTGTAAGGAGGTTAAGTTAATAGGT-3’,
SEQ ID NO.8:5’-CCCACCCTCAACTATCTACC-3’,
SEQ ID NO.11:5’-AACGCCGCTCACA-3’,
SEQ ID NO.12:5’-AACACCACTCACACTC-3’;
所述位置1-4在4号染色体SNCA基因启动子或第一外显子区域。
5.权利要求1-4任意一项所述的引物探针组合物在制备用于检测SNCA基因DNA甲基化水平的产品中的应用。
6.权利要求1-4任意一项所述的引物探针组合物在制备用于诊断或监测帕金森病及其相关疾病的产品中的应用。
7.一种检测SNCA基因DNA甲基化水平的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1-4任一项所述的引物探针组合物。
8.一种检测帕金森病及其相关疾病的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1-4任一项所述的引物探针组合物。
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