[发明专利]一种与杂交黄颡鱼“黄优1号”耐低氧性状相关的SNP分子标记及其应用在审
| 申请号： | 202010036854.0 | 申请日： | 2020-01-14 |
| 公开（公告）号： | CN111187843A | 公开（公告）日： | 2020-05-22 |
| 发明（设计）人： | 尹绍武;王宏玉;王涛;张凯;暨杰;武兆文 | 申请（专利权）人： | 南京师范大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人： | 郑立发 |
| 地址： | 210046 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 杂交 黄颡鱼 低氧 性状 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种与杂交黄颡鱼“黄优1号”耐低氧性状相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的序列如SEQ ID NO:1所示，所述SNP分子标记位于所述SEQ ID NO：1所示序列的第495位，碱基为T或A。
2.根据权利要求1所述的与杂交黄颡鱼“黄优1号”耐低氧性状相关的SNP分子标记，其特征在于，SNP位点的TT基因型个体耐低氧能力显著高于AA基因型个体。
3.一种用于检测权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物对，其特征在于，包括正向引物、反向引物，所述引物对的核苷酸序列分别如下所示：
正向引物：5’-TGAAGAGTCCGAGCGATT-3’，如SEQ ID NO:2所示。
反向引物：5’-ACTGCGAGGAGGATGAAC-3’，如SEQ ID NO:3所示。
4.一种用于检测权利要求1或2所述的SNP分子标记的试剂盒，其特征在于，包含权利要求3所述的引物对。
5.权利要求1或2所述的SNP分子标记、权利要求3所述的引物对或权利要求4所述的试剂盒在杂交黄颡鱼“黄优1号”辅助耐低氧苗种筛选中的应用。
6.一种检测杂交黄颡鱼“黄优1号”耐低氧性状的方法，其特征在于，包括通过对待测杂交黄颡鱼“黄优1号”进行权利要求1或2所述的SNP分子标记的检测，确定所述待测杂交黄颡鱼“黄优1号”的耐低氧能力。
7.根据权利要求6所述的检测杂交黄颡鱼“黄优1号”耐低氧性状的方法，其特征在于，包括提取待测杂交黄颡鱼“黄优1号”的基因组DNA，利用权利要求3所述的引物对或权利要求4所述的试剂盒进行PCR扩增，检测其SNP位点的基因型是TT、TA还是AA，最后进行不同基因型与杂交黄颡鱼“黄优1号”耐低氧性状的相关性分析，所述耐低氧能力为低氧条件下存活的时间。
8.根据权利要求7所述的检测杂交黄颡鱼“黄优1号”耐低氧性状的方法，其特征在于，所述SNP位点的TT基因型个体耐低氧能力显著高于AA基因型个体。
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