[发明专利]一种从哺乳动物粪便中高效富集宿主DNA的方法有效
申请号: | 202010037073.3 | 申请日: | 2020-01-14 |
公开(公告)号: | CN113186185B | 公开(公告)日: | 2023-05-26 |
发明(设计)人: | 徐艳春;崔靓玉;杨淑慧;马跃 | 申请(专利权)人: | 东北林业大学;深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 哈尔滨市阳光惠远知识产权代理有限公司 23211 | 代理人: | 邓宇 |
地址: | 150036 黑龙*** | 国省代码: | 黑龙江;23 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 哺乳动物 粪便 高效 富集 宿主 dna 方法 | ||
1.一种从哺乳动物粪便中富集宿主DNA的方法,其特征在于,在提取粪便DNA前,先将粪便样本经PBS缓冲液和SDS预处理,所述预处理方法如下:
1)将粪便样本与10mmol/L磷酸缓冲液PBS溶液混合后,加入SDS溶液至终浓度为质量分数0.01%~5%混匀,在室温下静置1~30min;所述粪便样本与磷酸缓冲液PBS溶液的比例为180~220mg:300μL;
2)然后离心取上清;所述离心条件为12000×g离心10min;
上清液用于DNA的提取。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)中针对草食兽粪便样本时,室温下静置时间为1~15min。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)中针对肉食兽粪便样本时,室温下静置时间为1~10min。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤1)中所述加入SDS溶液终浓度为质量分数1%。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤2)中所述提取DNA的方法包括基因组DNA试剂盒提取法和有机溶剂抽提法。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,步骤1)中所述草食兽粪便样本室温下静置时间为5min。
7.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,步骤1)中所述肉食兽粪便样本室温下静置时间为3min。
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