[发明专利]鉴别甲状腺良恶性结节的基因片段及其应用有效
申请号: | 202010038663.8 | 申请日: | 2020-01-14 |
公开(公告)号: | CN111100866B | 公开(公告)日: | 2020-12-18 |
发明(设计)人: | 肖海鹏;彭穗;刘蕊;王深明;程磊;吕伟明;洪澍彬;何其晔 | 申请(专利权)人: | 中山大学附属第一医院;上海鹍远生物技术有限公司 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12N15/11;C12Q1/6886 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 陶启长 |
地址: | 510062 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鉴别 甲状腺 恶性 结节 基因 片段 及其 应用 | ||
1.一种用于甲状腺结节良恶性鉴别的甲基化检测的引物分子,所述引物分子的扩增产物是(1)由SEQ ID NO:1和2作为引物扩增得到的BIN1基因的片段和(2)由SEQ ID NO:3和4作为引物扩增得到的DNM2基因的片段。
2.如权利要求1所述的引物分子,其特征在于,所述引物分子的序列选自:(1)SEQ IDNO:1和2所示的序列;和(2)SEQ ID NO:3和4所示的序列。
3.如权利要求1或2所述的引物分子,其特征在于,所述引物分子还包括检测内参基因ACTB的引物,其中,检测内参基因ACTB的引物的扩增产物是由SEQ ID NO:5和6作为引物扩增得到的ACTB基因的片段。
4.如权利要求3所述的引物分子,其特征在于,检测内参基因ACTB的引物为SEQ ID NO:5和6。
5.一种用于甲状腺结节良恶性鉴别的甲基化检测的探针分子,所述探针分子的序列如SEQ ID NO:7和8所示。
6.一种用于甲状腺结节良恶性鉴别的甲基化检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1-4中任一项所述的引物分子。
7.如权利要求6所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包含权利要求5所述的探针分子。
8.如权利要求6-7中任一项所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR反应试剂。
9.如权利要求8所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括检测DNA甲基化的试剂。
10.检测甲基化水平的试剂在制备甲状腺结节良恶性鉴别试剂盒中的应用,其特征在于,所述试剂用于检测样品中(1)由SEQ ID NO:1和2作为引物扩增得到的BIN1基因的片段的甲基化水平,和(2)由SEQ ID NO:3和4作为引物扩增得到的DNM2基因的片段的甲基化水平,所述鉴别包括根据所述甲基化水平判读甲状腺结节良恶性。
11.如权利要求10所述的应用,其特征在于,所述试剂包括引物分子,所述引物分子能扩增出由SEQ ID NO:1和2作为引物扩增得到的BIN1基因的片段或由SEQ ID NO:3和4作为引物扩增得到的DNM2基因的片段。
12.如权利要求11所述的应用,其特征在于,所述引物分子如权利要求1-4中任一项所述。
13.如权利要求10所述的应用,其特征在于,所述试剂包括探针分子,所述探针分子能与以下片段杂交:由SEQ ID NO:1和2作为引物扩增得到的BIN1基因的片段或由SEQ ID NO:3和4作为引物扩增得到的DNM2基因的片段。
14.如权利要求13所述的应用,其特征在于,所述探针分子如权利要求5所述。
15.如权利要求10-14中任一项所述的应用,其特征在于,所述样品来自哺乳动物的组织、细胞或者体液。
16.如权利要求10-14中任一项所述的应用,其特征在于,所述样品来自甲状腺组织或血液。
17.如权利要求10-14中任一项所述的应用,其特征在于,所述DNA是全基因组DNA和/或cfDNA。
18.如权利要求10-14中任一项所述的应用,其特征在于,所述检测包括:基于重亚硫酸盐转化的PCR、DNA测序、甲基化敏感的限制性内切酶分析法、荧光定量法、甲基化敏感性高分辨率熔解曲线法、基于芯片的甲基化图谱分析、质谱。
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