[发明专利]人类免疫缺陷病毒1型耐药基因型检测法及试剂盒有效
申请号: | 202010049859.7 | 申请日: | 2020-01-17 |
公开(公告)号: | CN111074004B | 公开(公告)日: | 2023-02-10 |
发明(设计)人: | 周素娟 | 申请(专利权)人: | 复旦大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6869;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 | 代理人: | 褚明伟 |
地址: | 200433 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 人类 免疫 缺陷 病毒 耐药 基因型 检测 试剂盒 | ||
1.用于检测人类免疫缺陷病毒1型耐药基因型的引物组,其特征在于,由引物A1、A2、A3、A4、B1、B2、B3、B4、C1、C2、C3、C4组成,
A1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
A2的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
A3的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
A4的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
B1的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示;
B2的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示;
B3的核苷酸序列如SEQ ID NO.7所示;
B4 的核苷酸序列如SEQ ID NO.8所示;
C1 的核苷酸序列如SEQ ID NO.9所示;
C2 的核苷酸序列如SEQ ID NO.10所示;
C3 的核苷酸序列如SEQ ID NO.11所示;
C4 的核苷酸序列如SEQ ID NO.12所示;
SEQ ID NO.1~12所示的核苷酸序列中的R为A/G,Y为C/T,B为G/T/C ,K 为G/T ,W为A/T,N为A/T/C/G;
其中,在常用的in-house基因型耐药检测HXB2株的pol基因扩增区域2243-3326nt之间设计引物分三段A区、B区、C区进行扩增,A区为2245-2583nt,B区为2615 -2951nt,C区为2880-3326nt,A1和A2、B1和B2、C1和C2分别为A区、B区、C区的巢式PCR第1轮的上下游引物,A3和A4、B3和B4、C3和C4分别为A区、B区、C区的巢式PCR第2轮的上下游引物,同时A3和A4、B3和B4、C3和C4也分别是A区、B区、C区的测序引物。
2.根据权利要求1所述用于检测人类免疫缺陷病毒1型耐药基因型的引物组,其特征在于,所述引物组能够检测的HIV-1亚型选自CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC、CRF_5501B、CRF_57BC、CRF_62_BC、 CRF_65cpx、CRF79_0107 、CRF_85_BC、CRF86_BC、CRF80_0107、CRF100_01C或CRF101_01B。
3.权利要求1或2所述用于检测人类免疫缺陷病毒1型耐药基因型的引物组的应用,其特征在于,所述引物组在制备HIV-1耐药检测试剂盒中的应用。
4.一种高效检测人类免疫缺陷病毒1型耐药基因型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1或2所述用于检测人类免疫缺陷病毒1型耐药基因型的引物组。
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