[发明专利]特异性检测HTLV-II前病毒DNA的引物及其应用在审
申请号: | 202010059162.8 | 申请日: | 2020-01-19 |
公开(公告)号: | CN113136453A | 公开(公告)日: | 2021-07-20 |
发明(设计)人: | 高歌;周安宇 | 申请(专利权)人: | 上海爱萨尔生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 北京瀚仁知识产权代理事务所(普通合伙) 11482 | 代理人: | 宋宝库;江宇 |
地址: | 201203 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 特异性 检测 htlv ii 病毒 dna 引物 及其 应用 | ||
1.特异性检测HTLV-II前病毒DNA的引物对,所述引物对包括正向引物5'-GCATCAAGCATTCTACCCATATAC-3'(SEQ ID NO:1)和反向引物5'-GAAGGTTAGGACAGTCTAGTAGATA-3'(SEQ ID NO:2)。
2.特异性检测HTLV-II前病毒DNA的引物和探针组合,所述引物对包括正向引物和反向引物,其中正向引物是5'-GCATCAAGCATTCTACCCATATAC-3'(SEQ ID NO:1),所述反向引物是5'-GAAGGTTAGGACAGTCTAGTAGATA-3'(SEQ ID NO:2);所述探针的序列为5'-CTGGTCGAGAGAACC-3'(SEQ ID NO:3),该探针的5’端标记报告荧光基团,3’端标记淬灭基团。
3.根据权利要求2的引物和探针组合,其中所述荧光探针的5’端标记的报告荧光基团为FAM,3’端标记的淬灭基团为NFQ-MGB或TAMRA。
4.根据权利要求1的引物对或根据权利要求2或3的引物和探针组合在检测样本中HTLV-II前病毒DNA中的应用。
5.根据权利要求1的引物对或根据权利要求2或3的引物和探针组合在制备用于检测样本中HTLV-II前病毒DNA的试剂中的应用。
6.根据权利要求4或5的应用,其中所述检测是qPCR检测或微滴式数字PCR(ddPCR)检测。
7.特异性检测HTLV-II前病毒DNA的试剂盒,该试剂盒包括根据权利要求1的引物对,或包括根据权利要求2或3的引物和探针组合。
8.根据权利要求7的试剂盒,所述试剂盒还包括选自qPCR反应液、水、HTLV-II前病毒DNA标准品、对照品中的任意一种或更多种试剂,或者包括选自ddPCR反应液、水中的任意一种或更多种试剂。
9.检测样本中HTLV-II前病毒DNA的方法,包括使用根据权利要求1的引物对,或使用根据权利要求2或3的引物和探针组合,对样本DNA进行qPCR检测或ddPCR检测,根据qPCR检测结果定性检测或定量检测样本中是否存在HTLV-II前病毒DNA。
10.检测样本中HTLV-II前病毒DNA的方法,包括以下步骤:
(1)提取样本DNA;
(2)使用根据权利要求1的引物对,或使用根据权利要求2或3的引物和探针组合,对HTLV-II前病毒DNA标准品和样本DNA进行qPCR检测,其中HTLV-II前病毒DNA标准品是用含有HTLV-II前病毒DNA片段的DNA配制的不同给定浓度的样品;
(3)用HTLV-II前病毒DNA标准品的qPCR检测结果制作标准曲线,拟合线性方程,其中R2≥0.99;且各标准品浓度的准确度(RE%)为-75%~150%,确定可稳定检测到的浓度最低点;
(4)结果判定:如果样本DNA的qPCR结果中出现明显的扩增曲线;且样本DNA的qPCR的Ct值小于浓度最低点的Ct值,则为阳性结果,即样本中存在HTLV-II前病毒DNA;如果无明显扩增曲线,或者有明显扩增曲线,但Ct值大于标准曲线浓度最低点的Ct值,则为阴性结果,即样本中不存在HTLV-II前病毒DNA。
11.根据权利要求10的方法,其中步骤(4)进一步包括:根据样本DNA的Ct值和拟合的标准曲线,确定样本DNA中HTLV-II前病毒DNA的浓度。
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