[发明专利]对虾虹彩病毒的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测引物组、试剂盒及其检测方法在审
申请号: | 202010062935.8 | 申请日: | 2020-01-20 |
公开(公告)号: | CN111118218A | 公开(公告)日: | 2020-05-08 |
发明(设计)人: | 黄俊;张徐俞;杨稳;丁雪燕;郑晓叶;付媛媛;骆志成;樊伟东 | 申请(专利权)人: | 杭州奥盛仪器有限公司;浙江科技学院;浙江省水产技术推广总站 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州知闲专利代理事务所(特殊普通合伙) 33315 | 代理人: | 万静 |
地址: | 310000 浙江省杭*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 对虾 虹彩 病毒 crispr cas12a 蛋白酶 等温 检测 引物 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种对虾虹彩病毒的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测引物组,包括:一对RPA引物、crRNA和一个包含荧光基团和猝灭基团的分子探针,其核苷酸序列如下所示:
SHIV-F:CAGATCAGAGCGCATTCGATCCCATAGGCACCGC;
SHIV-R:CGTAAGAGAACATGTGGTATCCGGTGAGTTCGGG;
SHIV-crRNA:UAAUUUCUACUAAGUGUAGAUCGGUGCCUAUGGGAUCGAAU;
SHIV-P:Fam-TTATT-BHQ1。
2.一种对虾虹彩病毒的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测试剂盒,包括CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测引物组,其特征在于,所述CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测引物组如权利要求1所示。
3.如权利要求2所述的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测试剂盒,其特征在于,还包括:RPA反应液,CRISPR-Cas12a蛋白酶缓冲液,CRISPR-Cas12a蛋白酶,RNA酶抑制剂,阳性对照和阴性对照;
所述RPA反应液由RPA Buffer,20×Core reaction,10×E-Mix和280mM醋酸镁组成;
所述阳性对照为含有对虾虹彩病毒CMP基因片段的T载体;
所述阴性对照为超纯水。
4.如权利要求1所述的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测引物组或权利要求2~3所述的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测试剂盒在快速鉴定对虾虹彩病毒中的应用。
5.一种对虾虹彩病毒的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取待检样品的DNA;
(2)利用权利要求1所述CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测引物组或权利要求2所述CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测试剂盒对步骤(1)获得的待检样品的DNA依次进行重组酶聚合酶等温扩增反应和CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测反应,并根据扩增产物的荧光变化判断扩增结果。
6.如权利要求5所述的对虾虹彩病毒的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测方法,其特征在于,
所述重组酶聚合酶等温扩增反应的反应体系为:总体积为25μl;
其中,10μM SHIV-F 1μl;10μM SHIV-R 1μl;RPA Buffer 12.5μl;20×core reaction1.25μL;10×E-Mix 2.5μL;280mM MgOAc 1.25μl,待检DNA 1~100ng,超纯水补齐到25μL;
所述CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测反应的反应体系为:总体积为20μl;
其中,10×Fncas12a Bufffer 2.5μl;10μM Fncas12a酶1μl;10μM crRNA 2μl;5U/μLRNase抑制剂1μl;10μM SHIV-P 1μl;重组酶聚合酶等温扩增反应的扩增产物1μL;超纯水补齐至20μL。
7.如权利要求5所述的对虾虹彩病毒的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测方法,其特征在于,所述重组酶聚合酶等温扩增反应的反应条件为:37℃反应10~20min;所述CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测反应的反应程序为:37℃预变性1s,37℃变性45s,37℃退火、延伸15s,循环40次。
8.如权利要求5所述的对虾虹彩病毒的CRISPR-Cas12a蛋白酶等温检测方法,其特征在于,所述判断扩增结果的方法为:收集荧光信号,如果出现扩增曲线则判定为阳性;如果无扩增曲线,则判定为阴性。
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