[发明专利]快速鉴别小麦AL型不育系的方法及所用的引物有效

专利信息
申请号: 202010075470.X 申请日: 2020-01-22
公开(公告)号: CN111394493B 公开(公告)日: 2022-07-08
发明(设计)人: 聂迎彬;田笑明;孔德真;崔凤娟;穆培源;徐红军;桑伟;韩新年;刘鹏鹏 申请(专利权)人: 新疆农垦科学院
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 代理人: 崔自京
地址: 832000 新疆维*** 国省代码: 新疆;65
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摘要:
搜索关键词: 快速 鉴别 小麦 al 不育 方法 所用 引物
【说明书】:

发明涉及一种快速分子鉴别小麦AL型不育系和保持系的方法及所用的引物,通过开发一种dCAPS分子标记,通过该分子标记对小麦AL型不育系和保持系,即A系和B系的快速和早期的分析鉴别。与现有技术相比,本发明可以在苗期就对育苗进行高效准确快捷的鉴定,及时采取不正当的手段相应的措施,可以进一步对后期的培育试验工作进行优化,提高试验的可靠性,并且降低或减少无用工作。

技术领域

本发明涉及一种快速鉴别小麦AL型不育系和保持系的方法及所用的引物。

背景技术

小麦AL型不育系和保持系在生长过程中的形态非常相近。

传统的区别方法是在小麦抽穗期通过观察进行鉴别,一是看农艺性状是否相近。如果相近,在抽穗期再观察散粉情况,不育系正常情况不散粉,保持系散粉。

其缺点缺陷是:用肉眼观察的准确性较低,特别是到了抽穗期之后,育种试验的大部分工作已经完成,如果出现杂株较多的情况,试验就会报废,而即便出现的杂株在可以忍受的范围内,也会在一定程度上造成工作的浪费。

因此,一种利用分子标记技术快速、准确鉴别小麦AL型不育系和保持系,即A系和B系鉴别开来的方法就应运而生。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是提供一种快速鉴别小麦AL型不育系和保持系的方法及所用的引物,通过开发一种dCAPS分子标记,通过该分子标记可以用于小麦AL型不育系和保持系,即A系和B系的快速和早期的分析鉴别,以进一步对后期的培育试验工作进行优化,提高试验的可靠性,并且降低或减少无用工作。

为实现上述目的,本发明提供以下的技术方案:

本发明的快速鉴别小麦AL型不育系和保持系的引物为序列表中的DNA序列2103和序列2102。

根据上述的引物,建立一种dCAPS分子标记,通过该分子标记可以用于小麦AL型不育系和保持系,即A系和B系的快速和早期的分析鉴别,以进一步对后期的培育试验工作进行优化,提高试验的可靠性,并且降低或减少无用工作。

本发明的快速鉴别小麦AL型不育系和保持系的方法如下:

根据差异SNP位点的基因序列,在保守区域设计引物:

TaChl-F1:TTTGCGAATTCCTACTTTGT;

TaChl-R1:GTGTATGTAGATCTAATTCT。

通过TaChl-F1/R1引物对,对提取的6个gDNA进行扩增,扩增产物用F1引物进行测序。

测序比对结果显示,在156碱基处A系品种碱基为A,B系品种碱基为C。

根据上面的测序结果,进行序列分析,选用限制性内切酶XmnI,并设计突变引物:

TaChl-F2(XmnI):TTTTTATTTTATAGTATTACTTCGAATTAATT。

XmnI的切割序列为GAANNNNTTC,

利用F2/R1引物对扩增出的序列为

A系:TTTTTATTTTATAGTATTACTTCGAATTAATTA

B系:TTTTTATTTTATAGTATTACTTCGAATTAATTC。

只有引物下游序列的第一个碱基为C的PCR产物才能被XmnI切开。

利用引物F2/R1对鉴定目标gDNA进行扩增,扩增产物(如图3)回收后均用XmnI进行酶切,酶切产物用2.0%的高分辨率的琼脂糖凝胶进行电泳,结果(如图4)显示B系的所有产物均被切开,而A系的所有产物没有被切开。

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