[发明专利]一种基于适配体传感器的高灵敏检测血清中PD-L1的方法有效

专利信息
申请号: 202010083389.6 申请日: 2020-02-09
公开(公告)号: CN111321204B 公开(公告)日: 2021-10-01
发明(设计)人: 李灏;胡鸿炜;丁于敬;高子涵 申请(专利权)人: 北京化工大学
主分类号: C12Q1/6825 分类号: C12Q1/6825;C12Q1/682;C12Q1/6806;C12N15/10
代理公司: 北京思海天达知识产权代理有限公司 11203 代理人: 刘萍
地址: 100029 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 适配体 传感器 灵敏 检测 血清 pd l1 方法
【权利要求书】:

1.寡核苷酸序列在制备基于适配体传感器的高灵敏检测血清中PD-L1的试剂盒中的用途,

所述寡核苷酸序列如下所示:

5’端修饰生物素的Apt38,记为Bio-Apt38:

5’-Biotin-AAG ACG GAC CAG CCT TGC CGC AAG ACG GAC CAG GGA TT-3’

扩增模板链3号,记为P3,划线为与Bio-Apt38碱基互补配对部分:

5’-AATCCCTGGTCCGTCTTGCGGCAAGGCTTT GAA TGA GGA GCA GCA CAG AGG TCA GAA CGATGG TCG ACA CAC GAT CAG AAG CTT GGC ATG GAT GAC GAC G-3’

上游引物,记为F1:

5’-AAT CCC TGG TCC GTC TTG CG-3’

下游引物,记为R1:

5’-CGT CGT CAT CCA TGC CAA GC-3’

其特征在于,基于适配体传感器的高灵敏检测血清中PD-L1包括如下步骤:

1)配制下述缓冲液

SELEX结合缓冲液:150mM氯化钠,5mM氯化钾,1mM氯化镁,1mM氯化钙,40mM HEPES,pH7.4;

链霉亲和素磁珠结合/清洗缓冲液BW buff:8mM Tris,1M氯化钠,1mM EDTA,0.02%(V/V)X-100,pH 7.8;

10×反应缓冲液:67mM甘氨酸,6.7mM氯化镁,10mM 2-巯基乙醇,pH 9.5;

2)首先,用生物素标记5'端的Apt38、P3和反向引物R1孵育,通过互补氢键杂交形成核酸复合物;设计了P3的3'端磷酸化和反向引物杂交,以保护互补DNA不被Exo I消化;同时,Apt38的3'端与P3的5'端杂交形成一个钝端,保护Apt38不被Exo I消化;

其次,用Q-PCR方法对同时释放的互补DNA进行扩增和定量;

3)信号双放大传感器构建过程

3.1漩涡混合器混匀链霉亲和素磁珠,转移到微离心管上,并放置在磁分离架上2min,抽吸并清除上清液,随后用BW buff洗涤磁珠2次,每次200μL;取Bio-Apt38、P3、R1混合均匀,95℃水浴5min,0℃冰水浴10min,并在室温下孵育60min,使三条核酸链通过碱基互补配对形成核酸复合物;加入已处理磁珠在22℃下孵育30min,转数80r/min,以形成磁珠-核酸复合物;

3.2磁分离,并用SELEX结合缓冲液洗涤四次每次200μL并重悬;加入10×反应缓冲液、Exo I核酸外切酶及梯度PD-L1蛋白溶液在22℃下孵育60min,转数80r/min;磁分离取上清液,85℃水浴15min;

3.3以表3-1配置Q-PCR体系并以表3-2设置Q-PCR程序,荧光阈值设定为100,检测Ct值随PD-L1蛋白浓度变化的关系,并用Origin8进行数据拟合分析;

表3-1 Q-PCR组成及含量

表3-2 Q-PCR程序

2.根据权利要求1所述的用途,其特征在于:

Exo I酶作用浓度为0.05U/μL-0.5U/μL。

3.根据权利要求1所述的用途,其特征在于:

酶切反应时间为20-120min。

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