[发明专利]用于检测丙型流感和丁型流感的双重TaqMan qPCR检测方法有效
申请号: | 202010104535.9 | 申请日: | 2020-02-20 |
公开(公告)号: | CN111187859B | 公开(公告)日: | 2022-06-07 |
发明(设计)人: | 粟硕;张乐天;潘中洲;王宁宁;何婉婷;鄢梓晴;高琪 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11 |
代理公司: | 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 | 代理人: | 黄欣 |
地址: | 210095 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 流感 双重 taqman qpcr 方法 | ||
1.一种用于检测丙型流感病毒和丁型流感病毒的qPCR试剂盒,其特征在于:包括用于检测丙型流感病毒的引物对及TaqMan探针、用于检测丁型流感病毒的引物对及TaqMan探针、反转录试剂和qPCR Mix;
所述用于检测丙型流感病毒的引物对及TaqMan探针的核苷酸序列如下所示:
ICV-NP正向引物:5’- AAGAGCCATGCAAGGAATTGA-3’
ICV-NP反向引物:5’- TCTGCGATGACATTTAGAGCTTC-3’
ICV-NP-Probe:5’-VIC- AAAGCGTTTCCTGGACCTTTAA-MGB-3’;
所述用于检测丁型流感病毒的引物对及TaqMan探针的核苷酸序列如下所示:
IDV-PB1正向引物:5’- CCCTCCTACAGGAACAGAGTTTTC -3’
IDV- PB1反向引物:5’- GCGTTGATACAACTGCCTCG -3’
IDV- PB1-Probe:
5’- FAM- AGGAACCCCTTTACACAGTTTGAGAAGACAG- BHQ1-3’。
2.一种用于检测丙型流感病毒和丁型流感病毒的双重TaqMan探针qPCR检测方法,该方法为非疾病诊断目的方法,其特征在于:包括以下步骤:
步骤1,获取待检样品的cDNA:提取鼻咽拭子样品或呼吸道组织病料的总RNA,反转录为cDNA模板;
步骤2,使用2对qPCR引物和TaqMan探针进行检测:将权利要求1所述试剂盒中的引物对和TaqMan探针置于qPCR反应体系中,以步骤1中获得的cDNA作为模板,进行PCR扩增,收集荧光信号;
步骤3,根据机器测算的荧光信号及Cq值判断样品中是否有丙型流感病毒、丁型流感病毒,Cq值大于35的结果判断为阴性。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:步骤1中反转录使用Revert Aid FirstStrand cDNA Synthesis Kit进行,其反应总体系为20 µL,包括:1 µL Random HexamerPrimer、1 µL Oligo(dT)18 Primer、5 µL nuclease-free Water、5 µL总RNA,混匀后65 ℃孵育5 min,冰浴3 min,继续加入:4 μL 5× Reaction Buffer、2 µL 10× dNTP预混液、1µL RevertAid M-MuLV Reverse transcriptase和1 µL RiboLock RNase Inhibitor。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:步骤1中反转录的反应程序为:25 ℃ 5min,42 ℃ 60 min,70 ℃ 5 min,反应后得到cDNA模板。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:步骤2中qPCR反应体系为:10µL 2× AceQqPCR Probe Master Mix,ICV-NP正向引物、ICV-NP反向引物、IDV-PB1正向引物、IDV- PB1反向引物各0.2 µL,ICV-NP-Probe、IDV-PB1-Probe各0.1 µL,cDNA模板2 µL,ddH2O加至体系总体积为20 μL,其中各条引物浓度和探针浓度均为10 μM,体系总体积为20 μL。
6.根据权利要求2所述的方法,其特征在于:步骤2中PCR扩增的反应程序设置为:荧光通道设置为:通道1:FAM,通道2:VIC;温控程序设置为:95 ℃预变性10 min;95 ℃变性10s,55 ℃退火10 s,72 ℃延伸20 s,45个循环,同时以荧光定量PCR仪器收集荧光信号。
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