[发明专利]一种检测三七圆斑病菌的LAMP引物及方法在审
申请号: | 202010106049.0 | 申请日: | 2020-02-21 |
公开(公告)号: | CN111057787A | 公开(公告)日: | 2020-04-24 |
发明(设计)人: | 兰成忠;林雄;代玉立;姚凤銮 | 申请(专利权)人: | 福建省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人: | 饶文君;蔡学俊 |
地址: | 350013 福建省*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 三七 病菌 lamp 引物 方法 | ||
1.一种用于检测三七圆斑病菌的LAMP引物,其特征在于,所述引物包括如下:
F3:5’- GCCTGTTCGAGCGTCATT -3’;
B3:5’- TCAGCGGGTATCCCTACC -3’;
FIP:5’- ACGCCGGCTGCCAATTGTTTTA-CCTCAAGCTCTGCTTGGTG -3’;
BIP:5’- CTTCGGAGCGCAGCACATTTTG-TCCGAGGTCAAGAGCGTTAA -3’。
2.一种利用权利要求1所述引物用于检测三七圆斑病菌的LAMP检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)待测样品DNA的提取:按照CTAB法或采用商品化试剂盒提取待测样品基因组DNA;
(2)LAMP扩增反应:以步骤(2)提取的待测样品DNA为模板,用步骤(1)的引物进行LAMP反应,LAMP检测反应体系为25 μL,包括5 μM引物F3和B3各1.0 μL,40 μM引物FIP和BIP各1.0 μL,LAMP反应混合液12.5μL,8 U
(3)反应结果的测定:采用荧光染料目测观察法进行测定,待LAMP反应结束后,在LAMP反应的扩增产物中加入显色剂SYBR greenⅠ 1.0 μL,在正常光照下,显色结果观察到绿色荧光,并且在波长为365nm的紫外光照射下呈白色浑浊沉淀状的判断为阳性,即存在三七圆斑病菌,在正常光照下,显色结果观察到橙色或橘黄色,并且在波长为365nm的紫外光照射下呈无色透明状的判断为阴性,即不存在三七圆斑病菌。
3.根据权利要求2所述的三七圆斑病菌的LAMP检测方法,其特征在于:所述LAMP反应混合液由以下组分组成:40 mM Tris-HCl,20 mM (NH4)2SO4,20 mM KCl,16 mM MgSO4,1.6mol/L甜菜碱,2.0 mM dNTPs,0.2wt.% Trion X-100。
4.权利要求1所述的引物或权利要求3所述的LAMP检测方法在三七圆斑病菌的早期诊断和病菌的监测、鉴定上的应用。
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