[发明专利]一种JAK2缺失突变基因及其检测方法在审
申请号: | 202010118550.9 | 申请日: | 2020-02-26 |
公开(公告)号: | CN111118162A | 公开(公告)日: | 2020-05-08 |
发明(设计)人: | 黄种山;其他发明人请求不公开姓名 | 申请(专利权)人: | 福建晨欣科生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12N15/54 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 350005 福建省福州市晋安*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 jak2 缺失 突变 基因 及其 检测 方法 | ||
1.一种JAK2突变基因,其特征在于:参照NCBI登录号为NG_009904.1的野生型JAK2基因序列,JAK2突变基因是由于野生型JAK2基因发生c.[84709-84714delctgcag]缺失突变而形成的;JAK2突变基因前84708位点序列同野生型JAK2基因相同位点序列一样;而JAK2突变基因从第84708+N位点起,其序列同野生型JAK2基因的第84714+N位点序列一样,N为1-65231范围内包含1和65231的整数;JAK2突变基因第84659-84758位点的序列即突变处前后50bp的序列如SEQ ID NO:2所示;JAK2基因发生c.[84709-84714delctgcag]突变的结直肠癌患者肺转移风险高。
2.如权利要求1所述的JAK2突变基因的检测分析方法,用于结直肠癌患者中JAK2突变基因的检测,其特征在于:JAK2突变基因的检测方法包括如下主要步骤:
(1)提取结直肠癌患者样本DNA
获取结直肠癌患者的癌灶组织或血液样本,癌灶组织可以是手术或活检穿刺获取的样本,血液样本可以是便于获取的外周静脉血,选用相应的试剂盒提取癌灶组织样本中的基因组DNA或血液样本中的细胞外游离DNA;
(2)扩增JAK2基因突变所在片段
以步骤(1)中提取的DNA为模板,采用如SEQ ID NO:5和SEQ ID NO:6序列所示的PCR引物进行扩增,按照常规PCR扩增体系,扩增条件为:95℃预变性3min;94℃变性15s,52℃退火15s,72℃延伸35s,循环30次;72℃终延伸5min;
(3)JAK2突变基因扩增片段测序分析
将步骤(2)中扩增的JAK2基因突变片段送基因公司进行Sanger测序,参照NCBI登录号为NG_009904.1野生型JAK2基因参考序列分析样本JAK2基因的特定突变信息,以此应用于结直肠癌患者肺转移的分析中:若结直肠癌患者样本中检出含有JAK2基因的c.[84709-84714delctgcag]突变,则表示其为肺转移或肺转移高风险。
3.如权利要求1所述的JAK2突变基因在构建结直肠癌患者肺转移分析的检测试剂盒和检测方法中的应用。
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