[发明专利]一种JAK2缺失突变基因及其检测方法

说明书

本发明首次提供了一种特定的人JAK2突变基因，该突变基因是由于野生型JAK2基因发生c.[84709‑84714delctgcag]缺失突变而形成的，其第84659‑84758位点的序列即突变处前后50bp的序列如SEQ ID NO：2所示。JAK2基因发生c.[84709‑84714delctgcag]突变的结直肠癌患者其肺转移风险高，其可以做为结直肠癌肺转移的有效可靠分子标志物；本发明还提供了基于PCR扩增和Sanger测序的JAK2突变基因检测分析方法，这些可以简便有效应用到结直肠癌患者肺转移的解析中，有助于结直肠癌患者肺转移的早发现和早干预，也可以为结直肠癌肺转移的机理解析提供线索。

技术领域

本发明涉及医学分子生物学领域，具体涉及一种第84709-84714位点发生c.[84709-84714delctgcag]缺失突变的JAK2突变基因及其应用。

背景技术

结直肠癌是中国人高发的癌种之一，其恶性程度高且易发生转移，具有很高的致死率。据WHO最新发布的《2018年全球癌症年报》显示，结直肠癌的发病率和死亡率均高居中国人常见癌症的第4位。临床上对于结直肠癌多采用以手术为主、放化疗为辅的综合治疗，但效果并不理想，其致死原因主要是根治术后的转移和复发。目前在结直肠癌患者的转移灶中，肺脏是十分常见的血行转移靶器官，其已经成为仅次于肝脏的第二常见的转移部位。据北京大学肿瘤医院1996年至2017年的回顾性资料显示，肺转移病例占所有转移性结直肠癌的32.9%，而初发肺转移的患者达24.5%。在初发肺转移患者中，单纯性肺转移占37.7%-44.5%，其中仅有21.1%-32.5%的患者可以接受肺转移灶的根治性切除手术治疗。

结直肠癌肺转移的及早发现十分关键，基于此才能实现及早预防和治疗，主要是可以增大患者行肺转移灶根治性切除的机会以及针对性开展预防性治疗。由于结直肠癌肺转移的分子机制尚未得到解析，因此目前临床上尚无准确可靠的结直肠癌肺转移的预测或评估指标，一些临床特征以及血清学指标其灵敏性和特异性都不足，无法从实质上及早有效地解析结直肠癌患者的肺转移风险。癌症本质上是一种基因病，其发生发展都是由特定基因群变异所驱动的，具有特定的基因指征。因此必须从基因水平上进行探究才能揭示结直肠癌肺转移的机制，从中找出相应的分子标志物，从而预测或及早发现结直肠癌患者的肺转移，这对于及时采取必要的临床干预或治疗措施以切实提高结直肠癌患者的生存率具有重要的意义和价值。

本发明研究时首先收集福建省内特定的结直肠癌家庭，对相关家庭成员进行全外显子组测序，通过分析比对首次发现了在结直肠癌肺转移患者中存在着JAK2基因的两种特定缺失突变即c.[41905-41909deltctga]突变和c.[84709-84714delctgcag]突变，进一步通过突变片段的PCR扩增和Sanger测序在结直肠癌患者人群中进行了验证。JAK2基因编码的JAK2(Janus kinase 2)激酶是蛋白酪氨酸激酶家族JAKs中的重要成员，而JAKs是许多细胞因子、生长因子及干扰素的重要信号传感器，涉及到多条从膜到核的重要信号通路（如JAK/STAT通路等）, 广泛参与细胞的增殖、分化、凋亡以及免疫调节等过程，其特定突变将会导致细胞失控。本发明提供的JAK2缺失突变基因尚未见报道，并且其对于结直肠癌患者肺转移的临床意义和价值尚未被揭示。

发明内容

本发明首次提供了特定的人JAK2缺失突变基因，其可以做为结直肠癌肺转移的分子标志物，同时提供了基于PCR扩增和Sanger测序的JAK2缺失突变基因检测分析方法，这些可以应用到结直肠癌患者肺转移的解析中，也可以为结直肠癌肺转移的机理解析提供线索。

本发明解决其技术问题所采用的技术方案如下：