[发明专利]一种基于lncRNA评分体系在预测肿瘤免疫治疗效果中的应用

权利要求书

1.一组预测肿瘤免疫治疗疗效或预后的lncRNA，其特征在于，由以下lncRNA组成：DLGAP1-AS1、RAMP2-AS1、BVES-AS1、LIPE-AS1、LINC01118、FGD5-AS1、AL513365.2、EMC1-AS1、FTX、SNHG15、TMEM147-AS1、TTN-AS1、FLG-AS1、CDKN2B-AS1、USP2-AS1、SBF2-AS1、AC113382.1、NOP14-AS1、AC012636.1、LINC01605、PCAT1、BRWD1-AS2、USP3-AS1、VPS9D1-AS1、AC093249.6、SNHG8、FUT8-AS1、NKILA、SLFNL1-AS1。

2.一种预测肿瘤免疫治疗疗效或预后的评分体系的构建方法，其特征在于，通过以下步骤实现：

(1)收集肿瘤患者数据；具体方法为：收集肿瘤患者所有lncRNA基因表达、CTL表达、肿瘤微环境免疫分子表达和基因表达数据及患者的生存预后信息数据；

(2)筛选与接受免疫治疗患者的生存具有显著相关性的长链非编码RNA(lncRNA)；具体方法为：通过单变量Cox回归模型检验筛选lncRNA，当其P值0.05时，认定该lncRNA与接受免疫治疗患者的生存具有显著相关性；最终筛选出如所述权利要求1所述的29个lncRNA；

(3)获得lncRNA评分公式，即为本发明可预测肿瘤免疫治疗疗效或预后的评分体系；所述lncRNA评分公式为：

LncRNA得分＝–(DLGAP1-AS1×0.0388404669)–(RAMP2-AS1×0.1155662963)–(BVES-AS1×0.0553720312)–(LIPE-AS1×0.1033882346)+(LINC01118×0.0796557151)–(FGD5-AS1×0.0289597115)–(AL513365.2×0.20586808)–(EMC1-AS1×0.0694844742)+(FTX×0.0852566063)+(SNHG15×0.1004314629)–(TMEM147-AS1×0.0720185014)+(TTN-AS1×0.0540188921)+(FLG-AS1×0.0526396975)–(CDKN2B-AS1×0.0064524961)+(USP2-AS1×0.0747066713)–(SBF2-AS1×0.1293691962)–(AC113382.1×0.2179618875)+(NOP14-AS1×0.0644565543)+(AC012636.1×0.1939511817)–(LINC01605×0.0168478032)+(PCAT1×0.1453946597)+(BRWD1-AS2×0.0298250867)–(USP3-AS1×0.0691270103)+(VPS9D1-AS1×0.0003103997)–(AC093249.6×0.0139283015)–(SNHG8×0.0014401603)–(FUT8-AS1×0.0852427371)+(NKILA×0.1318600645)–(SLFNL1-AS1×0.0472823654)。

3.如权利要求2所述的方法，其特征在于，所述步骤(3)中建立lncRNA评分公式的具体方法为：使用LASSO算法从步骤(2)筛选出的lncRNA中鉴定出29个lncRNA以构建有效的评分体系。