[发明专利]干扰素信号通路相关基因群及诊断产品和应用在审

专利信息
申请号: 202010141110.5 申请日: 2020-03-03
公开(公告)号: CN113337601A 公开(公告)日: 2021-09-03
发明(设计)人: 周彤;周伟庆;胡志元;马琳琳;陆俊欢 申请(专利权)人: 上海善准生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;G01N33/574;C12N15/12
代理公司: 北京永新同创知识产权代理有限公司 11376 代理人: 栾星明;程大军
地址: 201318 上海市浦东*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 干扰素 信号 通路 相关 基因 诊断 产品 应用
【权利要求书】:

1.一组用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素乳腺癌治疗指导的基因群,所述基因群包括:

基因群G1中的至少1个基因,和/或

基因群G2中的至少1个基因,和/或

基因群R中的至少1个基因;

所述基因群G1包括:IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9,

所述基因群G2包括:OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1,

所述基因群R包括:EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、PLSCR1、RSAD2和USP18。

2.权利要求1的基因群,其中所述基因群包括SAMD9和以下基因中的至少1个:IFI35、IFIT3、OAS2、OASL和RTP4。

3.权利要求1或2所述的基因群,其特征在于,

所述基因群还包括参考基因;

优选地,所述参考基因包括以下中的1个、更优选3个、最优选6个:GAPDH、GUSB、MRPL19、PSMC4、SF3A1、TFRC、ACTB和RPLP0。

4.权利要求1-3中任一项所述的基因群,其特征在于,

所述基因群包括:IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9,并且还任选包括ACTB、GAPDH和RPLP0;或者

所述基因群包括:OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1,并且还任选包括ACTB、GAPDH和RPLP0;或者

所述基因群包括:DDX58、DDX60、EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI35、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIH1、IFIT1、IFIT3、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、OAS2、OAS3、OASL、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SAMD9、SP110、USP18和XAF1,并且还任选包括GAPDH、GUSB、MRPL19、PSMC4、SF3A1、TFRC。

5.权利要求1-4中任一项所述的基因群,其特征在于,所述乳腺癌是HER2富集型或HER2阳性乳腺癌。

6.权利要求1-5中任一项所述的基因群,其特征在于,所述干扰素是I型干扰素。

7.用于检测权利要求1-6中任一项所述的基因群中的基因的表达水平的试剂。

8.权利要求7所述的试剂,其特征在于,所述试剂为

检测所述基因转录的RNA,特别是mRNA的量的试剂;或者

检测与mRNA互补的eDNA的量的试剂。

9.权利要求7或8所述的试剂,其特征在于,所述试剂为引物、探针或其组合。

10.权利要求9所述的试剂,其特征在于,

所述引物的序列和探针如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.97所示;和/或

所述引物的序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.70所示。

11.权利要求10所述的试剂,其特征在于,

所述引物的序列如SEQ ID NO.71-SEQ ID NO.88所示,和/或

所述探针的序列如SEQ ID NO.89-SEQ ID NO.97所示。

12.权利要求11所述的试剂,其特征在于,所述探针为TaqMan探针。

13.权利要求7所述的试剂,其特征在于,所述试剂为检测所述基因编码的多肽的量的试剂,优选地,所述试剂为抗体、抗体片段或者亲和性蛋白。

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