[发明专利]干扰素信号通路相关基因群及诊断产品和应用在审
申请号: | 202010141110.5 | 申请日: | 2020-03-03 |
公开(公告)号: | CN113337601A | 公开(公告)日: | 2021-09-03 |
发明(设计)人: | 周彤;周伟庆;胡志元;马琳琳;陆俊欢 | 申请(专利权)人: | 上海善准生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;C12N15/12 |
代理公司: | 北京永新同创知识产权代理有限公司 11376 | 代理人: | 栾星明;程大军 |
地址: | 201318 上海市浦东*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 干扰素 信号 通路 相关 基因 诊断 产品 应用 | ||
1.一组用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素乳腺癌治疗指导的基因群,所述基因群包括:
基因群G1中的至少1个基因,和/或
基因群G2中的至少1个基因,和/或
基因群R中的至少1个基因;
所述基因群G1包括:IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9,
所述基因群G2包括:OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1,
所述基因群R包括:EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、PLSCR1、RSAD2和USP18。
2.权利要求1的基因群,其中所述基因群包括SAMD9和以下基因中的至少1个:IFI35、IFIT3、OAS2、OASL和RTP4。
3.权利要求1或2所述的基因群,其特征在于,
所述基因群还包括参考基因;
优选地,所述参考基因包括以下中的1个、更优选3个、最优选6个:GAPDH、GUSB、MRPL19、PSMC4、SF3A1、TFRC、ACTB和RPLP0。
4.权利要求1-3中任一项所述的基因群,其特征在于,
所述基因群包括:IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9,并且还任选包括ACTB、GAPDH和RPLP0;或者
所述基因群包括:OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1,并且还任选包括ACTB、GAPDH和RPLP0;或者
所述基因群包括:DDX58、DDX60、EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI35、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIH1、IFIT1、IFIT3、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、OAS2、OAS3、OASL、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SAMD9、SP110、USP18和XAF1,并且还任选包括GAPDH、GUSB、MRPL19、PSMC4、SF3A1、TFRC。
5.权利要求1-4中任一项所述的基因群,其特征在于,所述乳腺癌是HER2富集型或HER2阳性乳腺癌。
6.权利要求1-5中任一项所述的基因群,其特征在于,所述干扰素是I型干扰素。
7.用于检测权利要求1-6中任一项所述的基因群中的基因的表达水平的试剂。
8.权利要求7所述的试剂,其特征在于,所述试剂为
检测所述基因转录的RNA,特别是mRNA的量的试剂;或者
检测与mRNA互补的eDNA的量的试剂。
9.权利要求7或8所述的试剂,其特征在于,所述试剂为引物、探针或其组合。
10.权利要求9所述的试剂,其特征在于,
所述引物的序列和探针如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.97所示;和/或
所述引物的序列如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.70所示。
11.权利要求10所述的试剂,其特征在于,
所述引物的序列如SEQ ID NO.71-SEQ ID NO.88所示,和/或
所述探针的序列如SEQ ID NO.89-SEQ ID NO.97所示。
12.权利要求11所述的试剂,其特征在于,所述探针为TaqMan探针。
13.权利要求7所述的试剂,其特征在于,所述试剂为检测所述基因编码的多肽的量的试剂,优选地,所述试剂为抗体、抗体片段或者亲和性蛋白。
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