[发明专利]干扰素信号通路相关基因群及诊断产品和应用

说明书

本发明属于生物技术领域，具体公开了干扰素信号通路相关基因群及其体外诊断产品，以及其在用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素治疗指导中的应用。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及干扰素信号通路相关基因群及其体外诊断产品和应用。

背景技术

乳腺癌占我国妇女恶性肿瘤发病的第一位，并以每年4％左右的速度逐年增加。由于乳腺癌的高度异质性，目前国内外在乳腺癌术后的精准治疗和降低复发风险等方面仍面临很大挑战。乳腺癌远处转移是乳腺癌复发中最为严重的类型，是判断预后的重要指标，也是造成患者死亡的主要原因。因此，预测乳腺癌的远处转移风险，对评估和改善患者的预后尤其重要。基于乳腺癌组织中的多基因表达谱提出的乳腺癌分子分型，可将乳腺癌分为能反映肿瘤生物学行为的亚型，并可评估各亚型的复发风险，指导化疗、内分泌治疗或靶向治疗等治疗方案的应用，具有重要的临床治疗指导意义。

具有不同的分子生物学特征(例如，HER2、激素受体(ER/PR)或其他肿瘤标志物的表达情况)与临床和病理指标(例如，患者年龄、肿瘤的分期和淋巴结的有无等)的乳腺癌在恶性程度、对内分泌治疗、靶向治疗或化疗等治疗方案的敏感性及预后等方面均存在较大差异。HER2富集型和HER2阳性乳腺癌对于针对HER2的靶向治疗+化疗的治疗方案较为敏感，但其病程发展迅速且预后较差。目前有待开发可用于评估HER2富集型和HER2阳性乳腺癌的复发风险和指导其治疗方案的检测手段和产品。

发明内容

在一方面，本发明涉及用于进行乳腺癌复发风险评估和/或干扰素乳腺癌治疗指导的基因群。优选地，所述乳腺癌是HER2富集型或HER2阳性乳腺癌。优选地，所述干扰素是I型干扰素。

在一实施方案中，本发明的基因群包括以下基因(G1)中的至少1个：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9。

在一优选实施方案中，本发明的基因群包括SAMD9和以下基因(G1)中的至少1个：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL和RTP4。

在另一实施方案中，本发明的基因群包括以下基因(G2)中的至少1个：OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1。

在另一实施方案中，本发明的基因群包括以下基因(R)中的至少1个：EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、PLSCR1、RSAD2和USP18。

在又一实施方案中，本发明的基因群包括以下基因中的至少1个：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9，和/或以下基因中的至少1个：OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1；并且还包括以下基因中的至少1个：EIF2AK2、HERC5、HERC6、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT5、IFITM1、ISG15、MX1、MX2、OAS1、PLSCR1、RSAD2和USP18。

在进一步优选的实施方案中，本发明的基因群还包括参考基因。优选地，所述参考基因包括以下中的至少1个、更优选3个、最优选6个：GAPDH、GUSB、MRPL19、PSMC4、SF3A1、TFRC、ACTB、RPLP0。

在一具体实施方案中，本发明的基因群包括：IFI35、IFIT3、OAS2、OASL、RTP4和SAMD9；以及ACTB、GAPDH和RPLP0。

在又一具体实施方案中，本发明的基因群包括：OAS3、DDX58、SP110、IFIH1、DDX60和XAF1；以及ACTB、GAPDH和RPLP0。