[发明专利]检测新型冠状病毒SARS-CoV-2的RT-LAMP引物组及试剂盒在审
申请号: | 202010150527.8 | 申请日: | 2020-03-06 |
公开(公告)号: | CN111518947A | 公开(公告)日: | 2020-08-11 |
发明(设计)人: | 朱丽萍;颜世敢 | 申请(专利权)人: | 齐鲁工业大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 250353 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 新型 冠状病毒 sars cov rt lamp 引物 试剂盒 | ||
1.检测新型冠状病毒SARS-CoV-2的RT-LAMP引物组及试剂盒,其特征在于引物组包括6条引物,序列如下:
引物F3:5’-TGGTATATTAGAGTAGGAGCTAGA-3’(SEQ ID NO:1),
引物B3:5’-AGTCTTCATAGAACGAACAAC-3’(SEQ ID NO:2),
引物FIP:5’-TCGATGTACTGAATGGGTGATTTAGTCAGCACCTTTAATTGAATTGTG-3’(SEQ ID NO:3),
引物BIP:5’-TACAGTTTCCTGTTCACCTTTTACAGCACTACAAGACTACCCAATT-3’(SEQ ID NO:4),
引物LF:5’-ATTAATTGCCAGGAACCTA-3’(SEQ ID NO:5)
引物LB:5’-AACCAGCCTCATCCACG-3’(SEQ ID NO:6)
2.根据权利要求1所述的引物组,其特征在于外侧引物(F3、B3):内侧引物(FIP、BIP):环引物(LF、LB)的摩尔比为1:8:4,每25ul RT-LAMP反应体系中含有引物F3、B3各5pmol,引物FIP、BIP各40pmol,引物LF、LB各20pmol。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于包括2×RT-LAMP反应液、阳性对照、阴性对照、DEPC水以及权利要求1或2所述的引物组。
4.根据权利要求1或3所述的2×RT-LAMP反应液,其特征在于2×LAMP反应液中含有的各组分及其浓度为:40mM Tris-HCl(pH8.8),20mM KCl,16mM MgSO4,20mM(NH4)2SO4,0.2%吐温20,1.6M甜菜碱,2.8mM dNTPs,1.28U/ul Bst DNA聚合酶,16U/ul AMV逆转录酶,1.6U/ul RNA酶抑制剂,0.1mM钙黄绿素,1.2mM MnCl2。
5.根据权利要求1或3所述的阳性对照,其特征在于SARS-CoV-2的ORF8基因全长DNA连接至pUC57载体筛选鉴定的阳性重组质粒,经体外转录获得RNA片段,经HPLC纯化后获得阳性对照品,1ug质粒拷贝数为3.157×1011。
6.根据权利要求1所述的引物组及试剂盒,其检测步骤为:向置冰盒内的反应管中添加引物组7ul、2×RT-LAMP反应液12.5ul、阳性模板1ul或待检样品RNA 1-3ul,用DEPC水补足体积至25ul,盖好反应管的盖子,混匀反应液,瞬时离心,使反应液位于管底,将反应管置水浴锅、金属浴、温箱或PCR仪中,在58-65℃范围内选择某一固定温度恒温扩增40-60分钟,优选为63℃扩增50分钟,然后85℃作用5分钟终止反应,在自然光或紫外灯下观察反应液的颜色,若反应液的颜色变为绿色,则判定待测样品中含有新型冠状病毒SARS-CoV-2;若反应液颜色仍为原来的棕褐色,则判定待测样品中不含新型冠状病毒SARS-CoV-2。
7.根据权利要求1所述的引物组及试剂盒,其特征在于在检测临床样品中是否存在新型冠状病毒SARS-CoV-2时应用。
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