[发明专利]一种病理切片组织区域快速配准算法在审
申请号: | 202010151108.6 | 申请日: | 2020-03-05 |
公开(公告)号: | CN111292315A | 公开(公告)日: | 2020-06-16 |
发明(设计)人: | 陈杰;郑众喜;王柄智;杨一明 | 申请(专利权)人: | 四川大学华西医院 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/30 |
代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李安霞;曾克 |
地址: | 610000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 病理 切片 组织 区域 快速 算法 | ||
1.一种病理切片组织区域快速配准算法,其特征在于包括以下步骤:
S100、从数字切片A1中获取缩略图a1,从数字切片A2中获取缩略图a2;
S200、从缩略图a1中分割出组织区域图b1,从缩略图a2中分割出组织区域图b2;
S300、以组织区域图b1为模板,以组织区域图b1和组织区域图b2的互信息度量为目标函数,从旋转角度、尺度变换、是否翻转三个维度搜索最优变换矩阵,使得组织区域图b1和变换后的组织区域图b2互信息度量最大,得到粗配准结果c1;
S400、以组织区域图b1作为模板,以粗配准结果c1作为初始化图像,优化组织区域图b1和粗配准结果c1中的相似性度量,即可快速收敛至最优解,得到精细配准结果。
2.根据权利要求1所述的配准算法,其特征在于:步骤S200中,分割算法包括阈值分割算法、区域生长分割算法、基于深度学习的分割算法。
3.根据权利要求1所述的配准算法,其特征在于:步骤S300中,最优变换矩阵的确定方法包括以下步骤:
S3111、将组织区域图b2旋转角度p,得到组织区域图b2′1,比较组织区域图b2′1与组织区域图b1,得到互信息度量k1;
S3112、将组织区域图b2′1旋转角度p,得到组织区域图b2′2,比较组织区域图b2′2与组织区域图b1,得到互信息度量k2;
……
S311i、将组织区域图b2′i-1旋转角度p,得到组织区域图b2′i,比较组织区域图b2′i与组织区域图b1,得到互信息度量ki;
……
S311n、将组织区域图b2′n-1旋转角度p,得到组织区域图b2′n,比较组织区域图b2′n与组织区域图b1,得到互信息度量kn;
S312、从互信息度量k1~互信息度量kn中选取最大互信息度量kmax,确定相对应的最适合的旋转角度,获得组织区域图b2_1,
其中1<i<n,n*p=360°。
4.根据权利要求3所述的配准算法,其特征在于:步骤S300中,最优变换矩阵的确定方法还包括以下步骤:
S3211、将组织区域图b2_1变换倍率q,得到组织区域图b2_1′1,比较组织区域图b2_1′1与组织区域图b1,得到互信息度量x1;
……
S321h、将组织区域图b2_1′h-1变换倍率q,得到组织区域图b2_1′h,比较组织区域图b2_1′h与组织区域图b1,得到互信息度量xh;
……
S321m、将组织区域图b2_1′m-1变换倍率q,得到组织区域图b2_1′m,比较组织区域图b2_1′m与组织区域图b1,得到互信息度量xm;
S322、从互信息度量x1~互信息度量xm中选取最大互信息度量xmax,确定相对应的最适合的变换倍率,获得组织区域图b2_2。
5.根据权利要求1所述的配准算法,其特征在于:步骤S300中,最优变换矩阵的确定方法还包括以下步骤:
S331、翻转组织区域图b2_2,得到组织区域图b2_2′,比较组织区域图b2_2′与组织区域图b1,得到互信息度量y,比较互信息度量y和最大互信息度量xmax,得到对应的粗配准结果c1。
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