[发明专利]一种病理切片组织区域快速配准算法在审
申请号: | 202010151108.6 | 申请日: | 2020-03-05 |
公开(公告)号: | CN111292315A | 公开(公告)日: | 2020-06-16 |
发明(设计)人: | 陈杰;郑众喜;王柄智;杨一明 | 申请(专利权)人: | 四川大学华西医院 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/30 |
代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李安霞;曾克 |
地址: | 610000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 病理 切片 组织 区域 快速 算法 | ||
本发明公开一种病理切片组织区域快速配准算法,包括以下步骤:S100、从数字切片A1中获取缩略图a1,从数字切片A2中获取缩略图a2;S200、从缩略图a1中分割出组织区域图b1,从缩略图a2中分割出组织区域图b2;S300、以组织区域图b1为模板,以组织区域图b1和组织区域图b2的互信息度量为目标函数,从旋转角度、尺度变换、是否翻转三个维度搜索最优变换矩阵,使得组织区域图b1和变换后的组织区域图b2互信息度量最大,得到粗配准结果c1;S400、以组织区域图b1作为模板,以粗配准结果c1作为初始化图像,优化组织区域图b1和粗配准结果c1中的相似性度量,即可快速收敛至最优解,得到精细配准结果。本发明配准流程泛化能力更好,配准效率更高。
技术领域
本发明涉及图像匹配技术领域,尤其涉及一种病理切片组织区域快速配准算法。
背景技术
临床上,病理科组织学免疫组化染色会从同一个组织上取多张切片,用不同的染色剂进行染色,医生阅片时都是在脑海中做配准。这种方法在切片染色过淡时很难在脑海中有效配准,医生需要反复对比才能在脑海中将区域重叠起来。
目前已有的方案是直接在取数字扫描切片上的图像执行配准,但不同的切片通常存在旋转、翻转、位移和轻微形变情况。直接配准方法既耗时长,又不能保证能正确配准。
发明内容
本发明旨在提供一种病理切片组织区域快速配准算法,配准流程泛化能力更好,配准效率更高。
为达到上述目的,本发明是采用以下技术方案实现的:
本发明公开一种病理切片组织区域快速配准算法,包括以下步骤:
S100、从数字切片A1中获取缩略图a1,从数字切片A2中获取缩略图a2;
S200、从缩略图a1中分割出组织区域图b1,从缩略图a2中分割出组织区域图b2;
S300、以组织区域图b1为模板,以组织区域图b1和组织区域图b2的互信息度量为目标函数,从旋转角度、尺度变换、是否翻转三个维度搜索最优变换矩阵,使得组织区域图b1和变换后的组织区域图b2互信息度量最大,得到粗配准结果c1;
S400、以组织区域图b1作为模板,以粗配准结果c1作为初始化图像,优化组织区域图b1和粗配准结果c1中的相似性度量,即可快速收敛至最优解,得到精细配准结果。
优选的,步骤S200中,分割算法包括阈值分割算法、区域生长分割算法、基于深度学习的分割算法。
优选的,步骤S300中,最优变换矩阵的确定方法包括以下步骤:
S3111、将组织区域图b2旋转角度p,得到组织区域图b2′1,比较组织区域图b2′1与组织区域图b1,得到互信息度量k1;
S3112、将组织区域图b2′1旋转角度p,得到组织区域图b2′2,比较组织区域图b2′2与组织区域图b1,得到互信息度量k2;
……
S311i、将组织区域图b2′i-1旋转角度p,得到组织区域图b2′i,比较组织区域图b2′i与组织区域图b1,得到互信息度量ki;
……
S311n、将组织区域图b2′n-1旋转角度p,得到组织区域图b2′n,比较组织区域图b2′n与组织区域图b1,得到互信息度量kn;
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