[发明专利]RT-qPCR法检测树鼩SLC22A8基因转录水平的方法、试剂盒及引物在审

专利信息
申请号: 202010162525.0 申请日: 2020-03-10
公开(公告)号: CN111172251A 公开(公告)日: 2020-05-19
发明(设计)人: 李哲丽;唐东红;叶尤松;王陈芸;李涛;徐瑾;董鑫;张铭娟;黄明峰 申请(专利权)人: 中国医学科学院医学生物学研究所
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851;C12N15/11
代理公司: 昆明正原专利商标代理有限公司 53100 代理人: 于洪;陈左
地址: 650118 *** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: rt qpcr 检测 slc22a8 基因 转录 水平 方法 试剂盒 引物
【权利要求书】:

1.用于非诊断目的RT-qPCR法检测树鼩SLC22A8基因转录水平的方法,其特征在于,包括如下步骤:

步骤(1),cDNA第一链的合成:

分别以健康和待测树鼩新鲜组织提取的总RNA为模板,逆转录合成得树鼩肾脏组织cDNA第一链;所述的新鲜组织为新鲜肾脏、肝脏、小肠组织;

步骤(2),健康树鼩GAPDH基因、SLC22A8基因的扩增:

以Easy dilution梯度稀释步骤(1)得到的健康树鼩组织cDNA第一链,分别以未稀释cDNA第一链及稀释后的cDNA为模板,进行实时荧光定量检测,并分别以SLC22A8 F和SLC22A8 R、GAPDH F和GAPDH R为特异性引物,进行实时荧光定量PCR扩增,分别得到健康树鼩GAPDH基因、SLC22A8基因的溶解曲线和扩增曲线;

步骤(3),标准曲线的建立:

以起始模板量拷贝数Log10的对数值为X轴,以Ct值为Y轴进行绘制,分别得到GAPDH基因、SLC22A8基因的标准曲线;

步骤(4),待测树鼩GAPDH基因、SLC22A8基因的扩增:

将步骤(1)得到的待测树鼩组织cDNA第一链分别以SLC22A8 F和SLC22A8 R、GAPDH F和GAPDH R为特异性引物,进行实时荧光定量PCR扩增,扩增体系和扩增程序与步骤(2)相同,分别得到待测树鼩GAPDH基因、SLC22A8基因的溶解曲线和扩增曲线;

步骤(5),树鼩SLC22A8基因转录水平的定量:

根据步骤(2)得到的标准曲线进行计算,得到树鼩SLC22A8基因转录水平;

所述的SLC22A8 F、SLC22A8 R、GAPDH F、GAPDH R引物的序列如下:

SLC22A8 F:5'-cagtcatccggcaaagaggt-3';

SLC22A8 R:5'-caggaagggcttcacctcag-3';

GAPDH F:5'-agccccatcaccatcttcc-3';

GAPDH R:5'-aatgagccccagccttctc-3'。

2.根据权利要求1所述的用于非诊断目的RT-qPCR法检测树鼩SLC22A8基因转录水平的方法,其特征在于,以Easy dilution梯度稀释步骤(1)树鼩组织cDNA第一链,梯度稀释倍数分别为5倍、25倍、125倍、625倍。

3.根据权利要求1所述的用于非诊断目的RT-qPCR法检测树鼩SLC22A8基因转录水平的方法,其特征在于,实时荧光定量PCR扩增体系下:SYBR Premix Ex Taq II (2x) 5μL,上、下游引物各0.4μL,cDNA模板0.8μL,去离子水3.4μL,总计10μL,上、下游引物浓度均为10μM;

实时荧光定量PCR扩增程序为:95℃预变性30s,95℃变性10s、60℃退火30s、40个循环。

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