[发明专利]一种SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测试剂盒及检测方法在审
申请号: | 202010174838.8 | 申请日: | 2020-03-13 |
公开(公告)号: | CN111139317A | 公开(公告)日: | 2020-05-12 |
发明(设计)人: | 王丽华;贺梦醒;铁晓威 | 申请(专利权)人: | 欧陆分析技术服务(苏州)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12R1/93 |
代理公司: | 北京同辉知识产权代理事务所(普通合伙) 11357 | 代理人: | 刘洪勋 |
地址: | 215000 江苏省苏州市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 sars cov 病毒 多重 荧光 定量 pcr 检测 试剂盒 方法 | ||
1.一种SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测方法,其特征在于:从样本中提取SARS-COV-2病毒,通过一步多重荧光探针体外扩增法同时扩增SARS-CoV-2病毒的ORF1ab基因和N基因片段,对扩增产物进行多重荧光定量PCR检测,所述ORF1lab基因的特异性引物和荧光探针序列如下:
上游引物具有SEQ ID NO.1的碱基对序列;
下游引物具有SEQ ID NO.2的碱基对序列;
荧光探针具有SEQ ID NO.3的碱基对序列;
所述N基因的特异性引物和荧光探针序列如下:
上游引物具有SEQ ID NO.4的碱基对序列;
下游引物具有SEQ ID NO.5的碱基对序列;
荧光探针具有SEQ ID NO.6的碱基对序列。
2.根据权利要求1所述的SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测方法,其特征在于:还通过一步多重荧光探针体外扩增法同时扩增了一个用于质控的MS2片段,所述MS2片段的特异性引物和荧光探针序列如下:
上游引物具有SEQ ID NO.7的碱基对序列;
下游引物具有SEQ ID NO.8的碱基对序列;
荧光探针具有SEQ ID NO.9的碱基对序列。
3.根据权利要求2所述的SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测方法,其特征在于:所述SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测方法中的阳性对照为合成的病毒质粒核酸序列,包括所述ORF1lab基因、N基因和MS2片段,所述SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测方法中的阴性对照是无菌水。
4.根据权利要求1所述的SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
步骤一:取样品;
步骤二:使用病毒RNA提取试剂,净化柱,提取和纯化样品中的RNA;
步骤三:以所述步骤二中的RNA为模板,在50度的温度下,通过反转录酶转录得到对应DNA,DNA模板在PCR反应液中,利用热启动Taq聚合酶,在设定的链式反应条件下,进行PCR循环反应;
步骤四:选择FAM,HEX,Cy5为多重反应同时测试,设定阈值,由电脑分析并得到Ct值。
5.根据权利要求4所述的SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测方法,其特征在于:所述步骤二中的PCR反应体系终浓度组成如下:
PCR缓冲液中Mg2+浓度为3.3mM,dNTP的浓度为0.1-0.5mM,SARS-CoV-2特异性基因的上游引物、下游引物和探针上下游引物浓度为0.1-1.0M,探针浓度为0.1-0.5M,Taq酶浓度为0.5-5U/反应,每个测试20-1000个拷贝病毒基因组模板;
所述步骤二中的反应条件为:50℃RNA逆转录15min,95℃水解、热启动DNA 15min,94℃15S退火,55℃延伸。
6.一种SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括用于检测SARS-COV-2病毒的所述权利要求1中ORF1ab基因和N基因序列的特异性引物和荧光探针序列,所述ORF1ab基因和N基因序列的特异性引物和荧光探针序列作为阳性对照使用。
7.根据权利要求6所述的SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于:还包括所述权利要求2中MS2片段的特异性引物和荧光探针序列,所述MS2片段的特异性引物和荧光探针序列在检测SARS-COV-2病毒的过程中作为过程控制参考物使用。
8.根据权利要求7所述的SARS-COV-2病毒多重荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括PCR反应液、反转录酶、热启动酶、所述过程控制参考物、阴性对照和所述阳性对照。
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