[发明专利]一种宏基因组二代测序的建库样本的制备方法在审
申请号: | 202010176692.0 | 申请日: | 2020-03-13 |
公开(公告)号: | CN111471676A | 公开(公告)日: | 2020-07-31 |
发明(设计)人: | 梁志坤;李贻林;吴英松;李明;杨学习;周俊华 | 申请(专利权)人: | 广州市达瑞生物技术股份有限公司 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 段卉 |
地址: | 510160 广东省广州市黄埔区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 宏基 二代 样本 制备 方法 | ||
1.一种宏基因组二代测序的建库样本的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
采集样本,并制备样本溶液;
裂解样本溶液中的宿主细胞,并消化样本溶液释放出的DNA,通过酶法和机械法进行破壁,得到样本1;
对样本溶液进行DNA酶消化,得到样本2;
将样本1和样本2合并,提取总核酸;
总核酸分为两部分:一部分去除rRNA,反转录为cDNA,与另一部分混合;
其中,裂解样本溶液中的宿主细胞的方法为,样本溶液与皂苷溶液混合,至皂苷的终质量浓度为0.22%~2.2%,孵育10~60min,再加入NaCl反应。
2.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,利用HL-SAN Buffer和HL-SAN消化样本溶液释放出的DNA,离心,弃上清,洗涤并重悬沉淀。
3.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,使用溶菌酶和溶胞酶进行酶法破壁。
4.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,破壁的具体方法为:向产物中加入溶菌酶和溶胞酶,37℃30min,之后加入锆珠,用组织研磨均质仪以6M/s速度破壁30s,之后12000g离心3min,取上清。
5.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,使用DNase I Buffer和RecombinantDNase I进行DNA酶消化。
6.根据权利要求1所述的制备方法,其特征在于,使用FastSelectTM RNARemoval Kit去除rRNA。
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