[发明专利]SLC26A4基因突变体及其应用

说明书

本发明提供了一种SLC26A4基因突变体及其应用。提供了一种基因突变，与野生型SLC26A4基因相比，具有c.128delG突变和/或c.1001+5GC突变。该基因突变是可检测的，通过检测该基因突变在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否患非综合征型耳聋。通过检测该基因突变，扩展和完善了遗传性听力损失疾病的检测和研究，为该疾病的诊断或治疗提供了新的检测位点以及新的检测方法和途径。

技术领域

本发明属于基因工程技术领域，具体涉及一种SLC26A4基因突变体及其应用。

背景技术

耳聋(hearing loss,HL)是最常见的感官功能障碍类疾病，相当一部分的耳聋患者的发病与遗传因素有关。通过基因检测手段确定耳聋发病的分子机制，从而进一步采取产前基因诊断和干预措施，是降低耳聋发生率的有效手段，也是耳聋防治的根本途径之一。根据是否有并发的其他临床表型，遗传性耳聋可分为综合征型耳聋(syndromic hearingloss,SHL)和非综合征型耳聋(non-syndromic hearing loss,NSHL)。

非综合征型耳聋在先天性遗传性耳聋中占70％左右，其中又有75％-80％为常染色体隐性遗传(autosomal recessive,AR)。迄今为止，已有超过100个基因座(loci)与常染色体隐性耳聋相关联，这些基因座被命名为DFNB。由不同致病基因导致的非综合征型耳聋在发病年龄、听力损失程度、进行性等方面存在明显差异。确定耳聋发病的致病基因有助于为患者选取合适的听力干预手段，更好地提高耳聋患者的生活质量。

随着测序技术的发展，越来越多的遗传性耳聋相关基因得到鉴定，为遗传性耳聋的分子学诊断提供了基础，使得更多的遗传性耳聋患者得到诊断与治疗。然而，由于遗传性耳聋具有很强的遗传异质性，目前仍有大量的致病基因未被鉴定，所以这方面的研究还有很大的空间，仍需要加强基因鉴定方面的研究。

发明内容

本发明旨在至少在一定程度上解决相关技术中的技术问题之一。为此，本发明的一个目的在于一种SLC26A4基因突变体及其应用。

全外显子测序(Whole-exome sequencing，WES)是应用频率最高的基因组测序方法。外显子是人基因组的蛋白编码区域，利用序列捕获技术可以将其DNA捕获并且富集。虽然外显子区域仅占全基因组1％左右，却包含了85％的致病突变。相比全基因组测序，全外显子测序更加经济、高效。外显子组测序主要用于识别和研究与疾病、种群进化相关的编码区及UTR区域内的变异。结合大量的公共数据库提供的外显子数据，有利于更好地解释所得变异与疾病的关系。

发明人针对自行收集的一例常染色体隐性非综合征型耳聋Trio家系(父母+先证者)，通过全外显子测序、家系分析联合Sanger测序验证的方法进行致病突变检测和验证。最终，根据各项检测结果，发明人确定了常染色体隐性非综合征型耳聋的新的致病突变——SLC26A4基因上的c.128delG突变，且该突变与患者另一条染色体上同一个基因的突变c.1001+5GC构成复合杂合(in trans)，导致了常染色体隐性非综合征型耳聋的发生。

SLC26A4基因定位于人类染色体7q31，包含21个外显子，由780个氨基酸组成，编码Pendrin跨膜转运蛋白，在机体离子成分平衡的维持中发挥重要作用。在内耳，Pendrin表达于内淋巴管、内淋巴囊、椭圆囊、球囊等处，异变的蛋白将对这些结构的正常生理功能产生影响，引发耳聋。