[发明专利]一种用于墨宝冬瓜杂交种子纯度鉴定的SSR引物及其应用

说明书

本发明公开了一种用于墨宝冬瓜杂交种子纯度鉴定的SSR引物，包括引物SSR11c160的上游引物SSR11c160‑F和下游引物SSR11c160‑R，上游引物SSR11c160‑F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，下游引物SSR11c160‑R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。还公开了一种墨宝冬瓜杂交种子纯度的鉴定方法，该引物能产生193bp的母本特异性标记和225bp的父本特异性标记，该引物重复性好、特异性强。该方法利用上述SSR引物，能准确、快速、有效的鉴定墨宝冬瓜杂交种子纯度。还公开了上述引物在墨宝冬瓜杂交种子以及墨宝冬瓜杂交种子纯度鉴定方面的应用。

技术领域

本发明属于冬瓜杂交种子纯度鉴定技术领域，具体涉及一种用于墨宝冬瓜杂交种子纯度鉴定的SSR引物及其应用。

技术背景

种子纯度是衡量种子质量的一项重要指标，影响作物的产量和产品质量。由于纯度低而导致的减产完全有可能抵消一个新品种的增产潜力，种子纯度低可为农业生产造成重大的损失。种子纯度鉴定主要有常规鉴定、生化鉴定和分子标记鉴定等方法。

常规鉴定包括田间种植鉴定，籽粒和幼苗形态鉴定及物理化学鉴定，这些方法存在耗时长，易受环境因素影响，用地多，可用于鉴定的标记性状少等缺点。

生化鉴定包括同工酶电泳、蛋白质电泳和高效液相色谱等方法，技术繁琐复杂。

分子标记鉴定方法具有不受环境限制，类型丰富，数量多，多态性高，共显性等优点。

常用的标记类型包括AFLP(扩增片段长度多态性)标记、RAPD(随机引物扩增多态性)标记、SRAP(相关序列扩增多态性)标记、RFLP(限制性片段长度多态性)标记等。

其中SSR标记采用PCR扩增方法，仅需采集微量组织提取DNA，且对样品DNA质量要求不高，样品处理技术简便；由于SSR标记呈共显性遗传，且多态性丰富，重复性好，结果稳定可靠，非常适合用于杂交种子纯度检测。

分子标记法在杂交种种子纯度鉴定中应用越来越广泛，有逐渐取代传统的形态鉴定法的趋势，目前已在水稻、黄瓜、南瓜、节瓜等作物杂交种纯度鉴定中应用。

墨宝冬瓜是广东省农业科学院蔬菜研究所育成的杂交一代小果型冬瓜品种。墨宝冬瓜具有瓜形美观、肉质紧实、皮色墨绿等特点，深受农户欢迎。

目前需探索一种可以快速准确且不受季节气候限制的对该品种进行纯度鉴定的方法。

发明内容

本发明的第一个目的在于提供一种用于墨宝冬瓜种子纯度鉴定的SSR引物，该引物能产生母本特异性标记和父本特异性标记(即共显性标记)，重复性好、特异性强。

本发明的目的还在于提供一种墨宝冬瓜种子纯度的鉴定方法，该方法利用上述SSR引物，能准确、快速、便捷、有效的鉴定墨宝冬瓜种子纯度。

本发明的第三个目的在于提供上述SSR引物在墨宝冬瓜杂交种子以及墨宝冬瓜杂交种子纯度鉴定方面的应用。

本发明的上述第一个目的可以通过如下技术方案来实现：一种用于墨宝冬瓜种子纯度鉴定的SSR引物，所述引物包括引物SSR11c160的上游引物SSR11c160-F和下游引物SSR11c160-R，其中上游引物SSR11c160-F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，所述的下游引物SSR11c160-R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

引物SS327的上游引物SSR11c160-F和下游引物SSR11c160-R的具体核苷酸序列分别如下：

SSR11c160-F：5’-GCCCACACTCACCTTACACA-3’(SEQ ID NO.1)；

SSR11c160-R：5’-AGCCCCACCGAATTAATGCT-3’(SEQ ID NO.2)。