[发明专利]早期肺腺癌患者预后评估系统及其应用

说明书

本发明公开了早期肺腺癌患者预后评估系统及其应用。本发明整合了三个独立队列的632例早期肺腺癌患者的无病生存期数据，建立和验证了个体化的早期LUAD患者的IBRS模型。三个独立队列包括TCGA、GSE31210和68例冰冻组织。所述IBRS模型由如下九种基因：DYNC1I2、THOC1、ADAM10、SERPINB6、CCL20、WNT2B、SLC11A1、MAPT、PSEN1组成。早期LUAD患者的IBRS模型的建立不仅有利于了解免疫分子之间复杂的相互作用机制，更给早期LUAD患者复发预测、治疗方案的优化带来巨大的帮助。

技术领域

本发明属于生物医学技术领域，具体涉及早期肺腺癌患者预后评估系统及其应用。

背景技术

肺癌是中国及世界范围内发病率较高的癌症，也是肿瘤相关死亡的最主要原因。肺腺癌(Lung adenocarcinoma，LUAD)是肺癌最常见的组织学亚型，约占肺癌的40％。尽管分子靶向药物、免疫检查点抑制剂等新的治疗措施不断发展，肺癌患者的五年生存率仍维持在17％左右。肺癌的高死亡率可归结于两大原因。66％的肺癌患者确诊时已是晚期，晚期肺癌的治疗手段选择有限，预后也较差。即使对于早期肺癌患者，术后五年复发率高达30-45％，死亡风险依旧很高。随着肺癌普查逐渐广泛地应用到临床实践中，越来越多的患者会在早期被诊断。因此，更应该致力于早期肺腺癌的治疗和管理。特别是找出具有高复发风险的早期癌患者以给予更多干预措施。

近年来研究表明，免疫系统中的许多成分是肿瘤发生发展的关键因子。逃避免疫破坏已是肿瘤公认的一大特征之一。尽管肺癌以往被认为是非免疫原性疾病，但新的证据显示缺乏有效的免疫反应是由于特定的免疫逃逸机制。揭示潜在的免疫逃逸机制开启了肺癌免疫治疗的新篇章。如靶向PD-1和PD-L1的免疫检查点抑制剂已经成功地应用于临床，给传统的肺癌治疗模式带来一场革命。此前已有研究报道肺癌中的免疫相关基因或免疫成分具有重要的预后预测价值。但是免疫相关基因是否可以预测早期肺癌复发仍有待研究。

鉴于免疫治疗在肺癌中的广阔前景及初诊时早期LUAD患者比例的提高，迫切需要在早期肺癌中建立基于免疫基因的复发标志物模型(immune gene-set based recurrencesignature，IBRS)。

发明内容

本发明所要解决的技术问题是如何对肺腺癌患者尤其是早期肺腺癌患者进行预后。

为解决上述技术问题，本发明首先提供了一种肺腺癌患者预后系统。

本发明提供的肺腺癌患者预后系统包括检测DYNC1I2、THOC1、ADAM10、SERPINB6、CCL20、WNT2B、SLC11A1、MAPT、PSEN1九种基因表达量的系统。

上述肺腺癌患者预后系统中，所述检测DYNC1I2、THOC1、ADAM10、SERPINB6、CCL20、WNT2B、SLC11A1、MAPT、PSEN1九种基因表达量的系统包括通过荧光定量PCR方法检测所述九种基因相对表达量所需的试剂和/或仪器。

进一步的，所述通过荧光定量PCR方法检测所述九种基因相对表达量所需的试剂和/或仪器包括检测DYNC1I2、THOC1、ADAM10、SERPINB6、CCL20、WNT2B、SLC11A1、MAPT、PSEN1九种基因相对表达量的引物对。检测各个基因的引物对序列具体如表2所示。

更进一步的，所述通过荧光定量PCR方法检测所述九种基因相对表达量所需的试剂和/或仪器还包括检测内参基因的引物对。所述内参基因具体为GAPDH基因。检测内参基因的引物对序列具体如表2所示。

上述肺腺癌患者预后系统中，所述系统还包含数据处理装置；所述数据处理装置内设模块；所述模块具有如下(a1)和(a2)所示的功能：