[发明专利]一种检测生物芯片样本的方法、装置及存储介质有效
申请号: | 202010200328.3 | 申请日: | 2020-03-20 |
公开(公告)号: | CN111257296B | 公开(公告)日: | 2023-04-11 |
发明(设计)人: | 吴琼;侯孟军;马小惠;王友学 | 申请(专利权)人: | 京东方科技集团股份有限公司 |
主分类号: | G01N21/64 | 分类号: | G01N21/64;G01B11/00;G01B11/26 |
代理公司: | 北京同达信恒知识产权代理有限公司 11291 | 代理人: | 黄丽 |
地址: | 100015 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 生物芯片 样本 方法 装置 存储 介质 | ||
1.一种检测生物芯片样本的方法,其特征在于,包括:
获得生物芯片对应的生物芯片图像;
确定所述生物芯片图像中每个反应腔室的位置信息,以及与所述生物芯片图像的四个边角对应的边角腔室;
确定所述边角腔室的偏转角度;
用所述偏转角度对所述生物芯片图像的偏转角进行校正;
确定所述校正后的生物芯片图像中,每个反应腔室对应区域的灰度标准差;
从所有灰度标准差中,确定出最大标准差和最小标准差;
根据所述最大标准差与所述最小标准差,以及它们的差值与第一阈值和第二阈值的大小关系,识别所有反应腔室的阴阳性。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,获得生物芯片对应的生物芯片图像,包括:
采集发生了生物化学反应的生物芯片的荧光图像;其中,所述生物芯片为四边形,所述生物芯片上呈阵列排布有多个反应腔室;
对所述荧光图像进行灰度处理,获得所述生物芯片图像。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于,获得所述生物芯片图像之前,还包括:
对进行了灰度处理的荧光图像进行降噪处理。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,确定所述生物芯片图像中每个反应腔室的位置信息,以及与所述生物芯片图像的四个边角对应的边角腔室,包括:
采用霍夫圆变换,识别所述每个反应腔室的位置信息;
将所有反应腔室中,与所述生物芯片图像的四个边角的欧氏距离最短的四个反应腔室,作为所述边角腔室。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,确定所述边角腔室的偏转角度,包括:
计算在第一方向和第二方向上相邻的两个边角腔室的中心连线与对应方向的夹角;其中,所述夹角为锐角,所述第一方向和所述第二方向分别为所述生物芯片图像的相邻两条边的延伸方向;
取所述四条中心连线对应的四个夹角的中位数作为所述偏转角度。
6.如权利要求1所述的方法,其特征在于,确定所述校正后的生物芯片图像中,每个反应腔室对应区域的灰度标准差,包括:
采用霍夫圆变换,识别所述校正后的生物芯片图像中每个反应腔室的位置信息;其中,所述位置信息包括反应腔室对应圆形区域的中心坐标位置和半径;
从所述校正后的生物芯片图像中,确定所述每个反应腔室对应区域中各像素点的灰度值;
计算所述反应腔室对应区域的灰度标准差。
7.如权利要求6所述的方法,其特征在于,确定所述每个反应腔室对应区域中各像素点的灰度值,包括:
确定所述每个反应腔室的第一矩阵;其中,所述第一矩阵中的元素个数与所述校正后的生物芯片图像的像素个数相同,一个反应腔室对应的第一矩阵中与所述一个反应腔室对应区域中的元素值为1,其它元素值为0;
将所述第一矩阵与所述校正后的生物芯片图像构成的矩阵进行点乘,获得所述每个反应腔室对应区域中各像素点的灰度值。
8.如权利要求1所述的方法,其特征在于,根据所述最大标准差与所述最小标准差,以及它们的差值与第一阈值和第二阈值的大小关系,识别所有反应腔室的阴阳性,包括:
若所述最大标准差值与所述最小标准差值之差小于等于所述第一阈值,则所有反应腔室均为阴性或阳性;
若所述最大标准差值大于所述第二阈值,则所有反应腔室均为阳性;若所述最大标准差值小于等于所述第二阈值,则所有反应腔室均为阴性;
若所述最大标准差值与所述最小标准差值之差大于所述第二阈值,则所述生物芯片中的反应腔室既有阴性又有阳性。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,当所述生物芯片中的反应腔室既有阴性又有阳性时,还包括:
采用类间方差最大化法,对各反应腔室对应区域的灰度标准差进行类型区分,获得各个反应腔室的阴阳性。
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