[发明专利]一种检测生物芯片样本的方法、装置及存储介质有效

专利信息
申请号: 202010200328.3 申请日: 2020-03-20
公开(公告)号: CN111257296B 公开(公告)日: 2023-04-11
发明(设计)人: 吴琼;侯孟军;马小惠;王友学 申请(专利权)人: 京东方科技集团股份有限公司
主分类号: G01N21/64 分类号: G01N21/64;G01B11/00;G01B11/26
代理公司: 北京同达信恒知识产权代理有限公司 11291 代理人: 黄丽
地址: 100015 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 生物芯片 样本 方法 装置 存储 介质
【说明书】:

发明公开了一种检测生物芯片样本的方法、装置及存储介质,该方法包括:获得生物芯片对应的生物芯片图像;确定所述生物芯片图像中每个反应腔室的位置信息,以及与所述生物芯片图像的四个边角对应的边角腔室;确定所述边角腔室的偏转角度;用所述偏转角度对所述生物芯片图像的偏转角进行校正;对校正后的生物芯片图像中所有反应腔室的阴阳性进行识别。

技术领域

本发明涉及生物医疗技术领域,尤指一种检测生物芯片样本的方法、装置及存储介质。

背景技术

在生物医疗领域中,阵列型生物芯片技术是对基因分析及疾病进行精确诊断的一种重要工具,能够克服传统方法需要多次重复试验的弊端,有效节约人力、样本量,提高了检测精度,是现代生物医疗领域中进行生物样本检测的重要手段之一。

阵列型生物芯片技术是将一定数量的生物化学反应空间(又被称之为反应单元或反应腔室)固定于一定面积的基片。在使用时,加载测试样本到芯片上,并提供反应条件令其发生反应,然后利用现有技术可检测到的光、电信号等作为反应发生强度,或反应发生与否的判断依据,间接获取测试样本的生物信息。

在对生物芯片样本点进行检测时,主要有以下三种方法:参数依赖的方法、标记辅助的方法、自动检测的方法。

参数依赖的方法依赖于人工设定或输入的参数,如行列坐标、反应腔室位置模板等,在使用时必须知晓芯片参数并准确输入方能得到检测结果,这在芯片种类多样或参数缺失的情况下会造成人力成本的提高。

标记辅助的方法需要在芯片上设计辅助标记,但目前芯片可能来自不同的生产方,不同生产方标记的设计方式不唯一,所以这种方法更适用于分析来自单一生产方的芯片,使得其灵活性较差。

自动检测的方法是通过提取图像特征,自主得到芯片行列数目、位置信息,对样本点的阴阳性进行检测和分析,这种方法可以分析多种阵列式生物芯片,其兼容性好、灵活性强,节约人力、生物样本成本,目前的自动检测方法主要是基于神经网络的方法,和二值化结果的投影直方图的网格划分法。

然而在采用上述自动检测的方法时,由于受光照影响使得提取的图像特征存在偏差,造成检测结果的准确度不高。

鉴于此,如何有效提高对生物芯片上的样本进行检测的准确度,成为一个亟待解决的技术问题。

发明内容

本发明实施例提供一种检测生物芯片样本的方法、装置及存储介质,用以解决现有技术中存在检测生物芯片样本的准确度较低的技术问题。

第一方面,为解决上述技术问题,本发明实施例提供一种检测生物芯片样本的方法,该方法包括:

获得生物芯片对应的生物芯片图像;

确定所述生物芯片图像中每个反应腔室的位置信息,以及与所述生物芯片图像的四个边角对应的边角腔室;

确定所述边角腔室的偏转角度;

用所述偏转角度对所述生物芯片图像的偏转角进行校正;

对校正后的生物芯片图像中所有反应腔室的阴阳性进行识别。

可选地,获得生物芯片对应的生物芯片图像,包括:

采集发生了生物化学反应的生物芯片的荧光图像;其中,所述生物芯片为四边形,所述生物芯片上呈阵列排布有多个反应腔室;

对所述荧光图像进行灰度处理,获得所述生物芯片图像。

可选地,获得所述生物芯片图像之前,还包括:

对进行了灰度处理的荧光图像进行降噪处理。

可选地,确定所述生物芯片图像中每个反应腔室的位置信息,以及与所述生物芯片图像的四个边角对应的边角腔室,包括:

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