[发明专利]一种定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的方法在审
申请号: | 202010205314.0 | 申请日: | 2020-03-20 |
公开(公告)号: | CN111254224A | 公开(公告)日: | 2020-06-09 |
发明(设计)人: | 王露楠;姬慧敏;常乐;闫颖;姜心怡;孙慧珍;郭飞 | 申请(专利权)人: | 北京医院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12N15/70 |
代理公司: | 天津欣达睿诚知识产权代理事务所(普通合伙) 12216 | 代理人: | 李欣 |
地址: | 100730*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 定量 检测 人类 淋巴细胞 病毒 方法 | ||
1.一种定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的质粒,其特征在于:所述质粒以大肠杆菌为载体,转化了该质粒的克隆菌株的保藏编号为CGMCC No.19437。
2.定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的一组核苷酸序列,其特征在于:具有序列表SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列。
3.一种定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的试剂,其特征在于:含有质粒标准品、检测HTLV-1和RPPH1的探针序列及引物序列;其中质粒以大肠杆菌为载体,转化了该质粒的克隆菌株的保藏编号为CGMCC No.19437。
4.根据权利要求3所述的一种定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的试剂,其特征在于:所述检测HTLV-1和RPPH1的探针序列及引物序列为实时荧光定量qPCR体系所用探针和引物。
5.根据权利要求3或4所述的一种定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的试剂,其特征在于:检测HTLV-1和RPPH1的引物序列及探针序列具有序列表SEQ ID NO.1~SEQ IDNO.6所示的核苷酸序列。
6.一种定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的方法,其特征在于:使用质粒模板、引物和探针序列,进行实时荧光定量qPCR反应,得到样本中的人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的含量。
7.根据权利要求6所述的一种定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的方法,其特征在于:所述质粒以大肠杆菌为载体,转化了该质粒的克隆菌株的保藏编号为CGMCC NO.19437。
8.根据权利要求6所述的一种定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的方法,其特征在于:所述引物和探针具有序列表SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.6所示的核苷酸序列。
9.根据权利要求6至8中任何一项所述的一种定量检测人类嗜T淋巴细胞病毒前病毒的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,提取待测样本的基因组DNA;
S2,实时荧光定量qPCR反应:将预混液、HTLV-1和内参RPPH1的引物和探针按照下表浓度放在同一qPCR管体系中,对5×108~1copies/μL的质粒标准品以及待检样本的进行扩增;
S3,制作标准曲线(以5×108~1copies/μL的质粒标准品制作标准曲线):以质粒标准品拷贝数的log10为横坐标,Ct值为纵坐标,构建标准曲线方程,得出HTLV-1基因和RPPH1内参基因qPCR的标准曲线;
S4,测定待测样品中HTLV-1的含量:将待检测样本的gDNA的HTLV-1基因和RPPH1内参基因扩增后得出的平均Ct值带入标准曲线,得到X1和X2,计算待检样本的HTLV-1拷贝数N(copies/100cell)=2×10(X1-X2)×100。
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