[发明专利]一种用于预测肿瘤突变负荷的核酸组合物及其方法和设备

权利要求书

1.一种用于预测肿瘤突变负荷的核酸组合物，应用于肺鳞癌样本检测，其特征在于，其由探针组1～9组成；

其中，探针组1包括用于捕获KMT2D基因的外显子区域的探针；

探针组2～9分别包括用于捕获DUSP22、MYCT1、OR1C1、OR4D11、OR4M2、OR4N4、TMEM132C和ZNF595基因的启动子及其上游区域的探针；

所述探针组1包括探针1～77，探针1～77的碱基序列分别如SEQ ID No.1～77所示；探针组2包括探针78～101，探针78～101的碱基序列分别如SEQ ID No.78～101所示；探针组3包括探针102～116，探针102～116的碱基序列分别如SEQ ID No.102～116所示；探针组4包括探针117～122，探针117～122的碱基序列分别如SEQ ID No.117～122所示；探针组5包括探针123～131，探针123～131的碱基序列分别如SEQ ID No.123～131所示；探针组6包括探针132～153，探针132～153的碱基序列分别如SEQ ID No.132～153所示；探针组7包括探针154～174，探针154～174的碱基序列分别如SEQ ID No.154～174所示；探针组8包括探针175～197，探针175～197的碱基序列分别如SEQ ID No.175～197所示；探针组9包括探针198～211，探针198～211的碱基序列分别如SEQ ID No.198～211所示。

2.一种用于预测肿瘤突变负荷的设备，应用于肺鳞癌样本检测，其特征在于，其包括存储单元及与所述存储单元电连接的执行单元；

其中，所述存储单元，用于存储预测待测样本肿瘤突变负荷的预测模型；

所述执行单元，用于接收如权利要求1所述的核酸组合物中的探针组1～9分别获取的对应基因的突变总数，并通过预测模型计算所述待测样本的肿瘤突变负荷；

所述预测模型的公式为：TMB＝3.0784+2.8282ⅹKMT2D+3.5622ⅹDUSP22+3.4638ⅹMYCT1+3.5757ⅹOR1C1+5.0473ⅹOR4D11+1.3990ⅹOR4M2+2.3760ⅹOR4N4+4.6992ⅹTMEM132C+1.1025ⅹZNF595；

公式中，KMT2D为KMT2D基因的突变总数；DUSP22为DUSP22基因的突变总数，以此类推。

3.根据权利要求2所述的用于预测肿瘤突变负荷的设备，其特征在于，所述设备还用于根据TMB值进行判读：当TMB值大于或等于10时，判读待测样本为TMB-H状态，当待测样本的TMB值小于10时，判定待测样本为TMB-L状态。