[发明专利]CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法在审

专利信息
申请号: 202010222934.5 申请日: 2020-03-26
公开(公告)号: CN111455048A 公开(公告)日: 2020-07-28
发明(设计)人: 刘建平;苏正;张克幍 申请(专利权)人: 中山大学孙逸仙纪念医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12Q1/6804
代理公司: 北京中誉至诚知识产权代理事务所(普通合伙) 11858 代理人: 张平力
地址: 510120 广东省广州市沿*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: cd90posi 细胞 circrna 差异性 表达 测试 方法
【权利要求书】:

1.一种CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,包括:

步骤S1:CD90posi细胞分选;

步骤S2:CircRNA高通量测序;

步骤S3:检测所述CircRNA的功能;

步骤S4:所述CircRNA作为标志物的差异表达。

2.根据权利要求1所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述CD90posi细胞分选利用磁珠偶联CD90posi抗体对肝癌细胞系97L、Huh7或肝癌组织进行分离。

3.根据权利要求2所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述肝癌组织经过Roche LRGE Blends组织消化体系分散为细胞悬液再分选,所述肝癌细胞系97L、Huh7直接用胰酶消化。

4.根据权利要求3所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述CircRNA高通量测序利用肝癌细胞与所述磁珠偶联CD90posi抗体共孵育通过磁场柱分离洗脱得到。

5.根据权利要求1所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述CircRNA在肝癌细胞中CD90posi细胞的差异表达通过获取肝癌细胞中CD90posi亚群总RNA构建CircRNA文库,进行CircRNA的高通量测序,所得结果进行生物信息学分析采集差异表达的分子。

6.根据权利要求1所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述CircRNA在肝癌组织中CD90posi细胞的差异表达通过分离患者的肿瘤组织CD90posi细胞总RNA,进行CircRNA高通量测序,生信分析CircRNA的表达差异进行富集分析。

7.根据权利要求1所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,采用pLCDH-ciR过表达质粒构建CircRNA过表达体系,采用sh-CiRcRNA的干涉质粒作为CircRNA沉默体系,感染细胞进行相关功能检测。

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