[发明专利]CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法在审
申请号: | 202010222934.5 | 申请日: | 2020-03-26 |
公开(公告)号: | CN111455048A | 公开(公告)日: | 2020-07-28 |
发明(设计)人: | 刘建平;苏正;张克幍 | 申请(专利权)人: | 中山大学孙逸仙纪念医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12Q1/6804 |
代理公司: | 北京中誉至诚知识产权代理事务所(普通合伙) 11858 | 代理人: | 张平力 |
地址: | 510120 广东省广州市沿*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cd90posi 细胞 circrna 差异性 表达 测试 方法 | ||
1.一种CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,包括:
步骤S1:CD90posi细胞分选;
步骤S2:CircRNA高通量测序;
步骤S3:检测所述CircRNA的功能;
步骤S4:所述CircRNA作为标志物的差异表达。
2.根据权利要求1所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述CD90posi细胞分选利用磁珠偶联CD90posi抗体对肝癌细胞系97L、Huh7或肝癌组织进行分离。
3.根据权利要求2所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述肝癌组织经过Roche LRGE Blends组织消化体系分散为细胞悬液再分选,所述肝癌细胞系97L、Huh7直接用胰酶消化。
4.根据权利要求3所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述CircRNA高通量测序利用肝癌细胞与所述磁珠偶联CD90posi抗体共孵育通过磁场柱分离洗脱得到。
5.根据权利要求1所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述CircRNA在肝癌细胞中CD90posi细胞的差异表达通过获取肝癌细胞中CD90posi亚群总RNA构建CircRNA文库,进行CircRNA的高通量测序,所得结果进行生物信息学分析采集差异表达的分子。
6.根据权利要求1所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,所述CircRNA在肝癌组织中CD90posi细胞的差异表达通过分离患者的肿瘤组织CD90posi细胞总RNA,进行CircRNA高通量测序,生信分析CircRNA的表达差异进行富集分析。
7.根据权利要求1所述的CD90posi细胞CircRNA的差异性表达测试方法,其特征在于,采用pLCDH-ciR过表达质粒构建CircRNA过表达体系,采用sh-CiRcRNA的干涉质粒作为CircRNA沉默体系,感染细胞进行相关功能检测。
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