[发明专利]用于检测SARS-CoV-2冠状病毒的试剂盒及其专用引物和探针在审
申请号: | 202010227826.7 | 申请日: | 2020-03-27 |
公开(公告)号: | CN113444830A | 公开(公告)日: | 2021-09-28 |
发明(设计)人: | 胡晨;王文超;孙永;俞俊岭;何军;刘青松;任涛;陈程;王黎;陈先涛 | 申请(专利权)人: | 中国科学院合肥物质科学研究院;安徽省疾病预防控制中心;合肥中科普瑞昇生物医药科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京尚诚知识产权代理有限公司 11322 | 代理人: | 龙淳 |
地址: | 230031 *** | 国省代码: | 安徽;34 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 sars cov 冠状病毒 试剂盒 及其 专用 引物 探针 | ||
1.用于对SARS-COV-2冠状病毒进行实时荧光定量PCR检测的引物和探针,其特征在于,所述引物包括上游引物SA-F1和下游引物SA-R1,其中所述SA-F1的核苷酸序列如SEQ IDNO:2所示,所述SA-R1的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示;所述探针的核苷酸序列如SEQ IDNO:4所示。
2.根据权利要求1所述的引物和探针,其特征在于,所述探针的5’端标记有荧光报告基团,3’端标记有荧光淬灭基团。
3.根据权利要求2所述的引物和探针,其特征在于,所述荧光报告基团为选自FAM、ROX、CY5、HEX中的任一种,所述荧光淬灭基团为选自TAMRA、BHQ、Eclipse中的任一种。
4.用于对SARS-COV-2冠状病毒进行实时荧光定量PCR检测的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1-3中任一项所述的引物和探针;
使用所述试剂盒时的20μL实时荧光定量PCR检测体系中所述引物和探针的用量为:每条引物的最终使用浓度各为0.1~1.0μM,探针的最终使用浓度为0.1~0.5μM。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中还包括阳性对照品和阴性对照品,阳性对照品为SARS-COV-2冠状病毒阳性质控品,阴性对照品为不含SARS-COV-2冠状病毒的反应体系。
6.权利要求4或5所述的试剂盒在对SARS-COV-2冠状病毒进行非疾病诊断目的的检测中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于:
为一种用实时荧光定量PCR技术对SARS-COV-2冠状病毒进行非疾病诊断目的的定性和定量检测方法,包括以下步骤:
1)建立标准曲线:将SARS-COV-2冠状病毒阳性质控品按照10倍梯度稀释至1×107copies/μL、1×106copies/μL、1×105copies/μL、1×104copies/μL、1×103copies/μL、1×102copies/μL、1×101copies/μL作为标准品;以不同浓度的标准品作为模板,在权利要求1-3中任一项所述的引物和探针的引导下进行实时荧光定量PCR检测,检测结束后,以各标准品的浓度Log值(X轴)对其相应Ct值(Y轴)作图,绘制标准曲线;
2)提取待测样品的基因组RNA,以提取的基因组RNA为模板,在权利要求1-3中任一项所述的引物和探针的引导下进行实时荧光定量PCR检测,同步进行检测阳性对照品和阴性对照品;
3)用得到的Ct值和荧光信号的变化实现对SARS-COV-2冠状病毒的定性检测,再根据Ct值和步骤1)中的标准曲线,得出待测样品中所含SARS-COV-2冠状病毒的拷贝数,实现定量检测。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述步骤2)中的待测样品包括用于疫苗生产的原料、疫苗半成品及成品。
9.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述步骤1)和步骤2)中的20μL实时荧光定量PCR检测体系包括:模板2μL、实时荧光定量一步法PCR反应液2×One Step RT-PCRBuffer III 10μL、PrimeScript RT Enzyme MixⅡ0.4μL、5U/μL TaKaRa Ex Taq HS 0.4μL、上游引物0.4μL、下游引物0.4μL、探针0.8μL、RNase Free ddH2O 5.6μL;
所述步骤1)和步骤2)中的实时荧光定量PCR检测条件为:反转录反应程序:42℃5min;95℃10sec;1个循环;PCR反应程序:95℃5sec;60℃20sec;40个循环。
10.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,所述步骤3)中的判定方法为:
若阳性对照品在荧光报告基团所对应的通道有S型扩增曲线,而阴性对照品在荧光报告基团所对应的通道无扩增曲线,则判断实验成立;否则实验结果无效;
当实验成立时进行以下判断:
若待测样品在荧光报告基团所对应的通道有S型扩增曲线,且Ct值≤38,则判定待测样品含有SARS-COV-2冠状病毒;
若待测样品在荧光报告基团所对应的通道有S型扩增曲线,且Ct值38,则判定待测样品为未确定样品,需重新提取RNA后进行检测;如果复检结果相同,则判定为弱阳性样品;
若待测样品在荧光报告基团所对应的通道无明显S型扩增曲线,则判定为阴性样品,即不含有SARS-COV-2冠状病毒。
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