[发明专利]一种用于检测血流感染致病菌及耐药基因的试剂盒在审
申请号: | 202010244106.1 | 申请日: | 2020-03-31 |
公开(公告)号: | CN113462793A | 公开(公告)日: | 2021-10-01 |
发明(设计)人: | 颜菁;杨朝;吕晓冬;高鹏飞 | 申请(专利权)人: | 上海邦先医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/6883;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 周敏;汪青 |
地址: | 201203 上海市浦东新区中国*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 血流 感染 致病菌 耐药 基因 试剂盒 | ||
1.一种用于检测血流感染致病菌及耐药基因的试剂盒,其特征在于:所述的试剂盒包括用于多重不对称PCR反应的引物对、以及含有探针的基因芯片;
所述的引物对包括对应于屎肠球菌鉴定基因msrC的引物对、对应于粪肠球菌鉴定基因FC-DDL的引物对、对应于嗜麦芽窄食单胞菌鉴定基因smeD的引物对、对应于耐药基因β-内酰胺酶C类AmpC酶DHA1的引物对中的一种或多种;
所述的探针包括主体序列以及在所述的主体序列的5’端标记的多个碱基T,至少部分所述的引物对和至少部分所述的探针对应于同一种血流感染致病菌或耐药基因;
所述的探针包括对应于屎肠球菌的探针、对应于粪肠球菌的探针、对应于嗜麦芽窄食单胞菌的探针、对应于β-内酰胺酶C类AmpC酶DHA1的探针中的一种或多种;
所述的对应于屎肠球菌鉴定基因msrC的引物对的正向引物序列为CTATCTCGCTGAAGCAAAGGACC,或与其具有至少80%的同源性;反向引物序列为GAAGCTCTTCAATCAGTCGATCAAT,或与其具有至少80%的同源性;
所述的对应于粪肠球菌鉴定基因FC-DDL的引物对的正向引物序列为TAACTTGGGCACAAACACCTGA,或与其具有至少80%的同源性;反向引物序列为AACGCTAGCTAAGACACCCGC,或与其具有至少80%的同源性;
所述的对应于嗜麦芽窄食单胞菌鉴定基因smeD的引物对的正向引物序列为CTCCAAGAGCCTTTCCGTCAT,或与其具有至少80%的同源性;反向引物序列为TCGGACTTCAGCGTGACCA,或与其具有至少80%的同源性;
所述的对应于耐药基因β-内酰胺酶C类AmpC酶的引物对的正向引物序列为GCCGTCTCCGTAAAGGGTAAG,或与其具有至少80%的同源性;反向引物序列为GCCTGCGGTATAGGTAGCCA,或与其具有至少80%的同源性;
所述的对应于屎肠球菌的探针的主体序列为CTTTCTTCTTATGAACAAGGGATGCTTCTAGACGAGCCAACAACC,或与其具有至少80%的同源性;和/或所述的对应于屎肠球菌的探针的主体序列为GACTGGAAGAAACTTCAGAGCGGAAATGGAGCGGAGGGGAAG,或与其具有至少80%的同源性;和/或所述的对应于屎肠球菌的探针的主体序列为ATGGAGCGGAGGGGAAGAACGAAAGATCGAGTTGATACG,或与其具有至少80%的同源性;
所述的对应于粪肠球菌的探针的主体序列为AGAAGCGATTGTTTTCCCTGTTTTACATGGGCCAAATGGTGA,或与其具有至少80%的同源性;和/或所述的对应于粪肠球菌的探针的主体序列为GTTTTACATGGGCCAAATGGTGAAGATGGAACAATTCAAGGA,或与其具有至少80%的同源性;和/或所述的对应于粪肠球菌的探针的主体序列为TTCAGGAAAACGAATCAGTCCTTCGGAAATTTATGAAGAAGAAGCGAT,或与其具有至少80%的同源性;和/或所述的对应于粪肠球菌的探针的主体序列为TGGTGAAGATGGAACAATTCAAGGATTCATGGAAACCATTAATATGCC,或与其具有至少80%的同源性;
所述的对应于嗜麦芽窄食单胞菌的探针的主体序列为GACAGTGCAAAGGGTCGGATTCGGCTCAGCAAC,或与其具有至少80%的同源性;
所述的对应于β-内酰胺酶C类AmpC酶DHA1的探针的主体序列为AAGAGATGGCGCTGAATGATCCGGCGGCAAAATACC,或与其具有至少80%的同源性。
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