[发明专利]一种基于网络药理学分析马钱子活性成分镇痛作用的方法有效
申请号: | 202010251476.8 | 申请日: | 2020-04-01 |
公开(公告)号: | CN111462814B | 公开(公告)日: | 2023-02-17 |
发明(设计)人: | 邓志军;郭洁文;刘若轩 | 申请(专利权)人: | 广州市中医医院(广州市中医中药研究所) |
主分类号: | G16B15/30 | 分类号: | G16B15/30;G16H50/70;G16H70/40 |
代理公司: | 广州帮专高智知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 44674 | 代理人: | 喻振兴 |
地址: | 512000*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 网络 药理学 分析 马钱子 活性 成分 镇痛 作用 方法 | ||
本发明公开一种基于网络药理学分析马钱子活性成分镇痛作用的方法,包括以下步骤:S1获取马钱子的化学成分与成分作用靶点:以马钱子为关键词,利用BATMAN‑TCM数据库检索获得符合条件的马钱子活性化合物及其靶向基因;S2识别疾病作用靶点:利用DisGeNET数据库获得与疼痛相关的虚拟目标靶标基因,马钱子活性化合物及其靶向基因进行交集,得药物‑疾病交集靶基因;S3构建马钱子与疾病网络,以及筛选核心节点;S4利用DAVID对核心节点进行GO富集和KEGG通路注释分析,预测靶点功能分布,并根据富集因子分析核心通路富集程度,解析马钱子镇痛作用机制。解决了目前马钱子研究周期长、缺乏系统性、研究目标单一等问题。
技术领域
本发明涉及中药网络药理学分析技术领域,具体涉及一种基于网络药理学分析马钱子活性成分镇痛作用的方法。
背景技术
中医学将病人当作一个具有不同状态的系统来进行治疗,具有悠久的历史,积累了大量的方剂。中医学的整体观念与网络药理学、网络生物学等前沿科技的核心思想具有相通之处,也符合了对肿瘤等复杂疾病进行系统性治疗的需求。“中药网络药理学”这一新领域的研究旨在从系统层次和分子水平揭示中药方剂的奥秘,促进中药研究从当前的“单一靶标,单一药物”模式转向“网络靶标,多成分药物”的新模式。近年来,中药网络药理学的一系列方法得以创建,包括基于网络的疾病基因预测、中药成分的靶标谱和药理活性预测、药物-基因-疾病的共模块分析、中药方剂多成分协同作用的大规模筛选、中药方剂的配伍规律和网络调节机理分析等。中药网络药理学能够为中医学从基于经验的医学迈向基于证据的医学提供新的途径,并能加速中药药物发现的进程,同时改进当前的药物研究策略。
马钱子为马钱科马钱属植物马钱子(Strychnosnux-vomica L.)的干燥成熟种子,味苦性温,大毒,归肝、脾经,具有通络止痛、散结消肿作用[1]。马钱子碱是马钱子主要活性成分,它主要作用于外周和中枢神经,对急性和炎性疼痛效果显著。马钱子碱是马钱子镇痛作用的主要药效成分,同时也是毒性成分,治疗剂量接近致死剂量,目前临床上尚未应用其单一制剂。马钱子复方制剂虽然在临床上已广泛用于疼痛治疗,但也存在作用机制不清楚、反应慢、有毒副反应等问题,使用受到限制。因此,加大对马钱子镇痛作用的研究和分析可为马钱子碱镇痛药物的开发提供重要的指导和依据。
发明内容
本发明旨在提供一种基于网络药理学分析马钱子活性成分镇痛作用的方法,将复杂网络分析技术和大数据技术有效的结合起来,分析、计算出马钱子活性成分的潜在作用靶点,解决了目前马钱子研究周期长、缺乏系统性、研究目标单一等问题。
本发明的技术方案是这样实现的:
一种基于网络药理学分析马钱子活性成分镇痛作用的方法,包括以下步骤:
S1、获取马钱子的化学成分与成分作用靶点:
以马钱子为关键词,利用BATMAN-TCM数据库检索马钱子现有活性化合物及其靶向基因,根据研究目标,设定筛选标准,获得符合条件的马钱子活性化合物及其靶向基因;
S2、识别疾病作用靶点:
利用DisGeNET数据库获得与疼痛相关的虚拟目标靶标基因,然后与S1获得符合条件的马钱子活性化合物的靶向基因进行交集,所得的交集基因即为药物-疾病交集靶基因;
S3、构建马钱子与疾病网络,以及筛选核心节点:
将S1获得符合条件的马钱子活性化合物及其靶向基因、S2得到的药物-疾病交集靶基因输入Cytoscape3.6.1软件中,利用Cytoscape3.6.1软件建立马钱子镇痛“成分-靶点-疾病”网络图,同时计算网络图中的所有节点,确定节点筛选条件,选取核心节点进行后续分析;
S4、对核心节点进行富集分析而解析马钱子镇痛作用机制:
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