[发明专利]香葱EST-SSR分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种香葱EST‑SSR分子标记，所述香葱EST‑SSR分子标记具有如编号为Cluster‑10188.0；Cluster‑11228.0；Cluster‑11382.0；Cluster‑11719.0；Cluster‑12571.0；Cluster‑13488.0；Cluster‑13953.0；Cluster‑14907.0；Cluster‑1547.0；Cluster‑1574.0；Cluster‑168.0；Cluster‑17176.0；Cluster‑18261.0；Cluster‑18284.1；Cluster‑18905.0；Cluster‑19764.0；Cluster‑19959.3；Cluster‑22324.0；Cluster‑22847.0；Cluster‑24908.0；Cluster‑2567.0；Cluster‑25807.1；Cluster‑2608.10612；Cluster‑2608.1143；Cluster‑2608.11633；Cluster‑2608.12824；Cluster‑2608.13377；Cluster‑2608.18176；Cluster‑2608.19044；Cluster‑2608.19078；Cluster‑2608.19327；Cluster‑2608.19412；Cluster‑2608.19628；Cluster‑2608.19820；Cluster‑2608.20126；Cluster‑2608.2015；Cluster‑2608.22133所示的序列。本发明方法首次使用EST‑SSR标记对香葱进行遗传多样性进行分析，操作简单，能对香葱种质进行有效区分，填补香葱SSR分子标记开发的空白。通过这些EST‑SSR标记的开发不仅丰富了香葱的分子标记数量，而且为其种质资源的遗传分析提供了理论依据。

技术领域

本发明涉及植物鉴别与育种技术领域，特别涉及香葱EST-SSR分子标记及其应用。

背景技术

香葱别名四季葱、菜葱、冬葱等，香葱一般株高约20-30公分，叶绿色，圆筒形，中空，先端渐尖，花白绿色，聚生成团，鳞茎基部易连生，群生状。香葱的外形就好比缩小的大葱，葱白长，叶子尖细，因为它确实是大葱的变种。属百合科葱属一年生或者多年生草本植物，因其鲜食、加工、园艺观赏及药用兼用，是日常生活中不可或缺的特色蔬菜品种之一。广西香葱年产值亿元，在促进地区经济进步与农民增收方面发挥着巨大的作用。然而，栽培葱属有着巨大的基因组，育种中存在缺乏遗传变异、遗传基础非常狭窄严重的近交系衰退的困扰。因此，开展香葱遗传育种研究具有重大意义。

遗传变异对促进植物育种和保护策略起到重要作用。通过研究可以了解物种的群体遗传结构和多态性水平，为研究物种起源、品种分类、亲本选配、品种保护等提供依据，是研究、保护和利用现有种质资源的重要基础。

分子标记是分析遗传变异的有用工具，为表型和基因型变异之间的联系提供了有效的手段。SSR分子标记检测的是基因组简单重复序列信息，因其呈共显性标记，多态性丰富，重复性好，已广泛应用于许多作物的基因定位、遗传连锁图谱构建、辅助育种、遗传多样性研究等方面。由于国内关于葱属作物遗传多样性研究主要集中在洋葱、大葱、韭菜、大蒜等葱属作物，使用的标记技术主要有形态标记、RAPD、AFLP、ISSR、SRAP等，说明SSR分子标记可有效进行葱属栽培品种的遗传多样性研究，但未见有香葱遗传多样性EST-SSR标记开发。与其他蔬菜作物相比，香葱分子育种技术应用研究相对较少，差距较大，尤其是分子标记技术在遗传育种上的应用亟待加强。

基于上述现有存在的问题，针对在香葱遗传多样性SSR标记开发的技术空白，本发明提供了一种香葱遗传多样性SSR标记。

公开于该背景技术部分的信息仅仅旨在增加对本发明的总体背景的理解，而不应当被视为承认或以任何形式暗示该信息构成已为本领域一般技术人员所公知的现有技术。

发明内容

本发明的目的在于提供一种香葱EST-SSR分子标记及其应用，不仅能丰富香葱的分子标记数量，还能使该分子标记在香葱种质资源分钟的有效利用。