[发明专利]一种检测绵羊ZNF280BY基因拷贝数变异的方法及其应用有效
申请号: | 202010287458.5 | 申请日: | 2020-04-13 |
公开(公告)号: | CN111349707B | 公开(公告)日: | 2021-12-14 |
发明(设计)人: | 乐祥鹏;徐海月;李发弟;王丽 | 申请(专利权)人: | 兰州大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6851 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人: | 范巍 |
地址: | 730000 甘肃*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 绵羊 znf280by 基因 拷贝 变异 方法 及其 应用 | ||
1.一种检测湖羊ZNF280BY基因拷贝数变异的方法在湖羊公羊分子标记辅助选择育种中的应用,其特征在于:所述的ZNF280BY基因的拷贝数与公羊繁殖性状显著负相关;
所述检测湖羊ZNF280BY基因拷贝数变异的方法,包括以下步骤:
以湖羊公羊基因组DNA模板,以引物对P1以及引物对P2为引物,分别通过实时定量PCR扩增ZNF280BY基因以及作为参照的DDX3Y基因的部分片段,然后根据定量结果鉴定ZNF280BY基因的拷贝数;
所述的引物对P1为:
上游引物F1:5’-GAAAACCCACACCACCTGCC-3’
下游引物R1:5’-GATCTGTAACTGCAAACCTGG-3’
所述的引物对P2为:
上游引物F2:5’-TCGCCGCTTGCTTACGTACACT-3’
下游引物R2:5’-ACACCCTCTGGTTAACGGCCAT-3’。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的ZNF280BY基因的拷贝数变异区域位于湖羊ZNF280BY基因CDS序列的1016位至1234位。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:基于引物对P1扩增的PCR产物片段大小为219bp,基于引物对P2扩增的PCR产物片段大小为136bp。
4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的实时定量PCR的扩增体系包括5ng/μL模板DNA 1μL,及10μmol/L的引物对P1或引物对P2所对应的上、下游引物各0.5μL。
5.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的实时定量PCR的扩增反应程序为:94℃预变性3min;94℃变性15s,69℃退火30s,72℃延伸20s,40个循环;72℃延伸5min。
6.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的繁殖性状选自睾丸重量和睾丸体积。
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