[发明专利]一种检测绵羊ZNF280BY基因拷贝数变异的方法及其应用有效

专利信息
申请号: 202010287458.5 申请日: 2020-04-13
公开(公告)号: CN111349707B 公开(公告)日: 2021-12-14
发明(设计)人: 乐祥鹏;徐海月;李发弟;王丽 申请(专利权)人: 兰州大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/6851
代理公司: 西安通大专利代理有限责任公司 61200 代理人: 范巍
地址: 730000 甘肃*** 国省代码: 甘肃;62
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摘要:
搜索关键词: 一种 检测 绵羊 znf280by 基因 拷贝 变异 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种检测湖羊ZNF280BY基因拷贝数变异的方法在湖羊公羊分子标记辅助选择育种中的应用,其特征在于:所述的ZNF280BY基因的拷贝数与公羊繁殖性状显著负相关;

所述检测湖羊ZNF280BY基因拷贝数变异的方法,包括以下步骤:

以湖羊公羊基因组DNA模板,以引物对P1以及引物对P2为引物,分别通过实时定量PCR扩增ZNF280BY基因以及作为参照的DDX3Y基因的部分片段,然后根据定量结果鉴定ZNF280BY基因的拷贝数;

所述的引物对P1为:

上游引物F1:5’-GAAAACCCACACCACCTGCC-3’

下游引物R1:5’-GATCTGTAACTGCAAACCTGG-3’

所述的引物对P2为:

上游引物F2:5’-TCGCCGCTTGCTTACGTACACT-3’

下游引物R2:5’-ACACCCTCTGGTTAACGGCCAT-3’。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的ZNF280BY基因的拷贝数变异区域位于湖羊ZNF280BY基因CDS序列的1016位至1234位。

3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:基于引物对P1扩增的PCR产物片段大小为219bp,基于引物对P2扩增的PCR产物片段大小为136bp。

4.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的实时定量PCR的扩增体系包括5ng/μL模板DNA 1μL,及10μmol/L的引物对P1或引物对P2所对应的上、下游引物各0.5μL。

5.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的实时定量PCR的扩增反应程序为:94℃预变性3min;94℃变性15s,69℃退火30s,72℃延伸20s,40个循环;72℃延伸5min。

6.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述的繁殖性状选自睾丸重量和睾丸体积。

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