[发明专利]胃H+ 在审
申请号: | 202010323873.1 | 申请日: | 2020-04-22 |
公开(公告)号: | CN111485019A | 公开(公告)日: | 2020-08-04 |
发明(设计)人: | 王永庆;孙鲁宁;李浩;张培培;周辰;王雨;刘菲;李玥琦 | 申请(专利权)人: | 江苏省人民医院(南京医科大学第一附属医院) |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/686;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 杨晓莉 |
地址: | 210029 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | base sup | ||
1.胃H+/K+-ATPase基因多态性检测引物,其特征在于,包括表1所示的分别针对T1327C、T2960C、G8815A、C9708T、T9837C和A9875G基因多态性检测位点的特异性引物:
表1 PCR引物
2.权利要求1所述检测引物在制备胃H+/K+-ATPase基因多态性检测试剂中的应用。
3.一种胃H+/K+-ATPase基因多态性检测试剂盒,其特征在于,包含权利要求1所述的特异性检测引物。
4.根据权利要求3所述的胃H+/K+-ATPase基因多态性检测试剂盒,其特征在于,还包含用于扩增含有所述6个突变位点的DNA的特异性引物的扩增反应液,所述扩增反应液组成如表2所示:
表2 PCR反应体系
5.根据权利要求3所述的胃H+/K+-ATPase基因多态性检测试剂盒,其特征在于,所述胃H+/K+-ATPase基因多态性检测试剂盒PCR扩增程序设置如表3所示:
表3 PCR反应程序设置
6.利用权利要求3-5中任一所述试剂盒检测样本质子泵H+/K+-ATPase基因型的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)合成表1所示的胃H+/K+-ATPase基因多态性检测引物;
(2)以样本胃H+/K+-ATPase基因组DNA为模板,利用步骤(1)合成的引物进行PCR扩增,产物纯化,毛细管自动测序,获得样本的基因型;
(3)样本基因测序后得到荧光吸收峰图和碱基排列顺序,用Lasergene软件进行分析比对,将出现基因突变的位点进行遗传密码子比对,得到特定氨基酸变化情况。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(1)中,在NCBI数据库中找到胃H+/K+-ATPaseα亚单位的DNA序列,确定与PPIs靶点相关的碱基突变位点,以该特定碱基位点为中心截取长短适宜的DNA序列片段,根据该位点的序列信息和引物设计规则,用Primer 5.0设计引物。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,引物扩增前首先配制Supermix液,混匀后分配到反应管中,每管24μL,最后加入DNA模板1μL。
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,PCR完毕,用1.5%的琼脂糖胶进行粗鉴定,然后采用3730XL型DNA测序仪进行毛细管自动双向测序确定碱基序列。
10.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述PCR扩增程序为:94℃预变性5min;94℃变性温度30s、58℃退火温度30s、72℃延伸50s,共35个循环;72℃终末延伸5min、4℃保持Forever。
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