[发明专利]非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测组合物、检测方法及检测试剂盒有效
申请号: | 202010324937.X | 申请日: | 2020-04-23 |
公开(公告)号: | CN111304371B | 公开(公告)日: | 2022-03-29 |
发明(设计)人: | 李艳;李春玲;勾红潮;孙铭飞;卞志标;蔡汝健;蒋智勇;宋帅;楚品品 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院动物卫生研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6851;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 苏运贞 |
地址: | 510640 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 非洲 猪瘟 病毒 野毒株 核酸 探针 荧光 定量 pcr 检测 组合 方法 试剂盒 | ||
1.一种非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测组合物,其特征在于包括用于扩增非洲猪瘟病毒野毒株的1组特异性引物对和1条LNA-Taqman探针:
所述的特异性引物对的序列如Seq ID No.1和Seq ID No.2所示;
所述的LNA-Taqman探针的序列如Seq ID No.3所示;
所述的LNA-Taqman探针的第11位、12位和13位碱基为锁核酸修饰碱基。
2.根据权利要求1所述的非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测组合物,其特征在于:所述的LNA-Taqman探针在5′端标记荧光物质,3′端标记淬灭物质。
3.根据权利要求2所述的非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测组合物,其特征在于:所述的5′端标记荧光物质为标记FAM,3′端标记淬灭物质为标记BHQ1。
4.权利要求1-3任一项所述的非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测组合物在制备非洲猪瘟病毒野毒株检测试剂盒中的应用。
5.一种非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于包括权利要求1-3任一项所述的非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测组合物。
6.根据权利要求5所述的非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于:
所述的检测试剂盒还包含阳性对照;
所述的阳性对照为包含非洲猪瘟病毒野毒株的MGF360-505R基因的重组质粒。
7.根据权利要求6所述的非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测试剂盒,其特征在于:所述的重组质粒的载体为pUC57。
8.权利要求5、6或7所述的非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测试剂盒在鉴定和/或检测非洲猪瘟病毒野毒株中的应用,所述的应用为非疾病诊断目的的用途。
9.一种非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测方法,所述的方法为非疾病诊断目的的方法,其特征在于包括如下步骤:
(1)提取样品的基因组DNA;
(2)配制锁核酸探针荧光定量PCR反应体系;
(3)将步骤(2)中配制的锁核酸探针荧光定量PCR反应体系置于荧光定量PCR仪中,进行扩增反应;
(4)将基因组DNA的循环阈值Ct与标准曲线对照,得到基因组DNA中非洲猪瘟病毒基因片段拷贝浓度;
其中,上游引物、下游引物和探针的序列依次如Seq ID No.1、Seq ID No.2和Seq IDNo.3所示;探针的第11位、12位和13位碱基为锁核酸修饰碱基。
10.根据权利要求9所述的非洲猪瘟病毒野毒株的锁核酸探针荧光定量PCR检测方法,其特征在于:
步骤(2)中所述的锁核酸探针荧光定量PCR反应体系为:2×Premix Ex Tag 10 μL、浓度为10 μmol/L的上游引物0.4 μL、浓度为10 μmol/L的下游引物0.4 μL、浓度为10 μmol/L的探针0.2 μL、模板DNA 1 μL、灭菌水加至20 μL;
步骤(3)中所述的扩增反应的反应条件为:预变性95℃、10 min;95℃、15 s,60℃、30s,扩增45个循环。
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