[发明专利]一种与稻米回生性紧密连锁的SNP位点及其分子标记和应用

权利要求书

1.一种与稻米回生性紧密连锁的SNP位点，其特征在于，所述SNP位点位于如SEQ IDNO.1所示的核苷酸序列中，所述SNP位点为位于该序列5’端起第86位、第888位、第1013位、第1014位、第1212位、第1255位、第1267位、第1760位、第1877位、第2372位、第2484位、第2507位、第2634位、第2647位、第2684位、第2717位、第2786位、第2856位、第2871位、第2886位、第3010位、第3022位、第3048位、第3108位、第3126位、第3182位、第3209位、第3226位、第3276位、第3333位、第3358位、第3378位、第3387位，以及第3392位的碱基。

2.根据权利要求1所述的与稻米回生性紧密连锁的SNP位点，其特征在于，所述第86位的碱基为G或T；所述第888位的碱基为A或T；所述第1013位的碱基为A或G；所述第1014位的碱基为G或A；所述第1212位的碱基为A或G；所述第1255位的碱基为C或T；所述第1267位的碱基为C或T；所述第1760位的碱基为T或G；所述第1877位的碱基为T或A；所述第2372位的碱基为G或A；所述第2484位的碱基为T或G；所述第2507位的碱基为A或G；所述第2634位的碱基为A或G；所述第2647位的碱基为G或A；所述第2684位的碱基为C或T；所述第2717位的碱基为A或G；所述第2786位的碱基为A或G；所述第2856位的碱基为A或G；所述第2871位的碱基为C或A；所述第2886位的碱基为T或C；所述第3010位的碱基为C或A；所述第3022位的碱基为T或C；所述第3048位的碱基为A或G；所述第3108位的碱基为C或A；所述第3126位的碱基为G或T；所述第3182位的碱基为G或A；所述第3209位的碱基为G或T；所述第3226位的碱基为T或C；所述第3276位的碱基为T或C；所述第3333位的碱基为A或G；所述第3358位的碱基为G或A；所述第3378位的碱基为C或T；所述第3387位的碱基为A或G；所述第3392位的碱基为A或G。

3.一种包含权利1或2所述SNP位点的基因，其特征在于，该基因的编码序列为如SEQ IDNO.1所示的核苷酸序列经取代、缺失和/或添加一个或多个核苷酸，且能编码相同功能蛋白质，包含相同SNP位点的核苷酸序列。

4.一种用于检测水稻回生性的SNP分子标记组合，其特征在于，包括权利要求1或权利要求2中所述的至少一个SNP位点。

5.权利要求1或2所述的任一SNP位点在开发dCAPS分子标记中的应用。

6.一种用于检测水稻回生性的dCAPS分子标记组合，其特征在于，包括权利要求1或权利要求2中所述的至少两个SNP位点。

7.权利要求5所述的dCAPS分子标记在水稻全基因组关联分析中的应用。

8.权利要求6所述的dCAPS分子标记组合在水稻全基因组关联分析中的应用。

9.一种水稻全基因组芯片，其特征在于，包括权利要求1或权利要求2所述的34个SNP位点，以及如SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。

10.权利要求9所述的水稻全基因组芯片在水稻回生性分子标记辅助育种中的应用。