[发明专利]一种适合沙棘的DNA提取方法在审

专利信息
申请号: 202010334913.2 申请日: 2020-04-25
公开(公告)号: CN111534508A 公开(公告)日: 2020-08-14
发明(设计)人: 王芳;李伟;吴鹏;郭茜茜;颜培玉;江新杰;张珍珠;刘林馨;王志刚;张智慧;赵金波 申请(专利权)人: 王芳
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 哈尔滨市松花江专利商标事务所 23109 代理人: 岳泉清
地址: 161000 黑龙江省齐齐哈尔市建*** 国省代码: 黑龙江;23
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摘要:
搜索关键词: 一种 适合 沙棘 dna 提取 方法
【说明书】:

一种适合沙棘的DNA提取方法,本发明涉及一种适合沙棘的DNA提取方法。本发明的目的是解决现有提取沙棘DNA的方法存在DNA纯度低的问题,本发明通过研磨前预冷,去掉了部分糖类物质,在研磨加入了PVP,减少了酚类、单宁类物质的影响,络合多酚和萜类物质,防止多酚类褐变而氧化,去糖缓冲液去除了糖类物质,为后续提取高质量DNA打好基础;用在CTAB缓冲液中加入蛋白酶K,在加快细胞膜破裂的同时,蛋白酶协同步骤四的盐酸胍去除了沙棘DNA中的粗蛋白,提高了DNA的纯度和产量。制备出的DNA OD260/OD280值可达1.92,DNA的纯度较高。本发明应用于分子生物学领域。

技术领域

本发明属于生物技术领域。

背景技术

沙棘为胡颓子科沙棘属,是一种落叶性灌木,为药食同源植物,其根、茎、叶、花、果,特别是沙棘果实含有丰富的营养物质和生物活性物质,具有止咳化痰、健胃消食、活血散瘀等功效。现代医学研究,沙棘可降低胆固醇,缓解心绞痛发作,还有防治冠状动脉粥样硬化性心脏病的作用;沙棘成长周期较长,一般3~4年才开花结果,为实现其经济价值,沙棘在分子生物学方面的研究亟待展开,便于后续在其优质种株鉴定,病虫害防治等方向的研究。

进行分子生物学分析的关键第一步,是提取高质量的基因组DNA,这是获得准确试验结果的基础。沙棘组织中富含多糖、多酚和粗蛋白,这些次生代谢物会严重的阻扰DNA的提取纯化。现有CTAB法提取植物基因组织中的DNA,是在CTAB缓冲液中加入PVP以去除少许多糖,加上用Tris-酚:氯仿:异戊醇来抽提蛋白质,OD260/OD280比值低于1.8,说明仍有较多的多糖及蛋白质与DNA混杂在一起,DNA纯度低。因此需要更加有效的方法来解决提取DNA中存在多糖和粗蛋白污染的问题,获得高纯度DNA。

发明内容

本发明的目的是解决现有提取沙棘DNA的方法存在DNA纯度低的问题,而提供一种适合沙棘的DNA提取方法。

一种适合沙棘的DNA提取方法,它按以下步骤实现:

一、取沙棘幼嫩叶片两枚置于EP管中加入蒸馏水,预冷处理,取出后自然风干并剪碎,得到剪碎的叶片;

二、用液氮将研钵预冷,加PVP于研钵中,加剪碎的叶片,加液氮将叶片研磨至粉末状,然后转移至离心管中,每管0.2~0.4g,再加入预冷的去糖缓冲液和β-巯基乙醇,混合后冰上静止9-15min,离心3-4min,弃上清,收集沉淀;其中PVP和剪碎的叶片的质量比为:0.04~0.06:1;

三、在上述沉淀中加入1mL 65℃预热的CTAB提取缓冲液、0.1~0.2mL的2mg/mL蛋白酶K和70~90μl的硼砂,置于超声波清洗器中65℃水浴5~10min,然后常温下离心,取上清液并加入80μl的PVP,常温下离心,取上清液;

四、取步骤三最终得到的上清液至离心管中,加入等体积的混合溶液,然后于37℃水浴处理30-35min,并每隔5min颠倒混匀,常温下离心,取上清液于EP管中;混合溶液:4~6mmol/L盐酸胍、10~20mmol/L Tris-HCl和质量浓度20%~30%的乙醇,

五、向步骤四得到的上清液中加入质量浓度20%~30%的乙醇,然后再加入Tris-酚、氯仿和异戊醇的混合液,颠倒混匀,离心,取上清液;

六、向步骤五上清液中加入等体积的氯仿和异戊醇的混合液,震荡混匀后,离心,取上清液;

七、向步骤六上清液中加入0.6倍体积的异丙醇,混匀后于-20℃沉淀30-35min,然后4℃下离心,取沉淀,再用2倍体积的质量浓度为70%的乙醇洗涤沉淀2~3次,离心,取沉淀并自然风干;

八、向风干后的沉淀中加入含RNase的TE溶液,37℃水浴处理30-35min,置于冰箱保存,即完成沙棘的DNA提取;

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